Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TXNRD1Q16881 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TXNRD1Q16881 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TXNRD1Q16881 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TXNRD1Q16881 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms