Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CLTCQ00610 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CLTCQ00610 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CLTCQ00610 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CLTCQ00610 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CLTCQ00610 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CLTCQ00610 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CLTCQ00610 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
CLTCQ00610 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CLTCQ00610 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CLTCQ00610 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CLTCQ00610 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CLTCQ00610 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CLTCQ00610 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
CLTCQ00610 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CLTCQ00610 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CLTCQ00610 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CLTCQ00610 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CLTCQ00610 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CLTCQ00610 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLTCQ00610 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLTCQ00610 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLTCQ00610 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLTCQ00610 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms