Protein–RNA interactions for Protein: P61978

HNRNPK, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPKP61978 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 28.5
HNRNPKP61978 NEU4-208ENST00000423583 753 ntTSL 517.67■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 28.5
HNRNPKP61978 NEU4-217ENST00000618597 3013 ntTSL 217.54■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 28.5
HNRNPKP61978 NEU4-209ENST00000426032 676 ntTSL 316.75■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 28.5
HNRNPKP61978 ATP2A1-204ENST00000562185 576 ntTSL 27.36□□□□□ -1.232e-9■■■■■ 28.5
HNRNPKP61978 LRP1-210ENST00000556247 611 ntTSL 316.6■□□□□ 0.254e-7■■■■■ 28.5
HNRNPKP61978 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 28.4
HNRNPKP61978 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 28.4
HNRNPKP61978 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 28.4
HNRNPKP61978 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 28.4
HNRNPKP61978 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 28.4
HNRNPKP61978 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 28.4
HNRNPKP61978 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 28.4
HNRNPKP61978 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 28.4
HNRNPKP61978 ANK1-209ENST00000520299 3587 ntTSL 28.5□□□□□ -1.051e-6■■■■■ 28.4
HNRNPKP61978 PTPRK-222ENST00000532751 563 ntTSL 421.97■■□□□ 1.111e-9■■■■■ 28.4
HNRNPKP61978 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.561e-9■■■■■ 28.4
HNRNPKP61978 PTPRK-208ENST00000392449 1456 ntTSL 216.79■□□□□ 0.281e-9■■■■■ 28.4
HNRNPKP61978 GAS6-202ENST00000476291 537 ntTSL 221.43■■□□□ 1.028e-8■■■■■ 28.4
HNRNPKP61978 PIDD1-209ENST00000531286 1937 ntTSL 218.95■□□□□ 0.623e-9■■■■■ 28.4
HNRNPKP61978 PIDD1-206ENST00000527812 481 ntTSL 316.57■□□□□ 0.243e-9■■■■■ 28.4
HNRNPKP61978 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.23e-9■■■■■ 28.4
HNRNPKP61978 PIDD1-205ENST00000527357 4496 ntTSL 213.55□□□□□ -0.243e-9■■■■■ 28.4
HNRNPKP61978 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.263e-9■■■■■ 28.4
HNRNPKP61978 PIDD1-204ENST00000525028 3175 ntTSL 1 (best)12.48□□□□□ -0.413e-9■■■■■ 28.4
HNRNPKP61978 PIDD1-203ENST00000524486 3917 ntTSL 212.12□□□□□ -0.473e-9■■■■■ 28.4
HNRNPKP61978 PIDD1-210ENST00000534525 3994 ntTSL 211.54□□□□□ -0.563e-9■■■■■ 28.4
HNRNPKP61978 ARPC2-214ENST00000480062 508 ntTSL 225.87■■□□□ 1.731e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 ARPC2-204ENST00000420104 482 ntTSL 325.28■■□□□ 1.641e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 ARPC2-217ENST00000489598 1039 ntTSL 225.28■■□□□ 1.641e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 ARPC2-203ENST00000414983 713 ntTSL 325■■□□□ 1.591e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 ARPC2-218ENST00000491780 577 ntTSL 424.77■■□□□ 1.561e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.531e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 ARPC2-205ENST00000420201 732 ntTSL 324.42■■□□□ 1.51e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.491e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.42e-11■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.252e-11■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 ASL-210ENST00000496336 996 ntTSL 1 (best)22.22■■□□□ 1.151e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 11e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 ASL-202ENST00000362000 928 ntTSL 220.69■□□□□ 0.91e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 SCAF8-204ENST00000461219 677 ntTSL 520.58■□□□□ 0.891e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 RCCD1-208ENST00000557266 2110 ntTSL 1 (best)20.42■□□□□ 0.862e-11■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 ASL-207ENST00000487982 1007 ntTSL 219.76■□□□□ 0.751e-8■■■■■ 28.3
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HNRNPKP61978 FAM49B-221ENST00000522361 367 ntTSL 419■□□□□ 0.631e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 FAM49B-209ENST00000518879 820 ntTSL 518.81■□□□□ 0.61e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 FAM49B-219ENST00000521223 587 ntTSL 418.79■□□□□ 0.61e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 FAM49B-208ENST00000518344 554 ntTSL 318.72■□□□□ 0.591e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 FAM49B-205ENST00000518167 421 ntTSL 518.32■□□□□ 0.521e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.471e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.461e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.432e-11■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.371e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 FAM49B-216ENST00000520204 699 ntTSL 516.57■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 FAM49B-210ENST00000519020 573 ntTSL 516.2■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 FAM49B-211ENST00000519070 561 ntTSL 316.05■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.151e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 NXN-203ENST00000571080 476 ntTSL 515.91■□□□□ 0.142e-16■■■■■ 28.3
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HNRNPKP61978 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.081e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 RCCD1-204ENST00000555737 3157 ntTSL 1 (best)15.47■□□□□ 0.072e-11■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.021e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.021e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 CDK19-205ENST00000460913 448 ntTSL 512.84□□□□□ -0.351e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 MAT2A-205ENST00000481412 1438 ntTSL 1 (best)12.21□□□□□ -0.451e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 RCCD1-209ENST00000557750 1696 ntTSL 312.1□□□□□ -0.472e-11■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 SCAF8-205ENST00000464628 468 ntTSL 511.78□□□□□ -0.521e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 FAM49B-220ENST00000522250 1647 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.521e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 FAM49B-215ENST00000519824 3798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.571e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 CDK19-204ENST00000457688 955 ntTSL 510.75□□□□□ -0.691e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 MAT2A-203ENST00000465151 583 ntTSL 210.11□□□□□ -0.791e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 SCAF8-202ENST00000367186 4908 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.811e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 MAT2A-201ENST00000306434 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.971e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 FAM49B-206ENST00000518283 574 ntTSL 48.81□□□□□ -11e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 CDK19-201ENST00000323817 6067 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.041e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 ERBB3-206ENST00000548709 551 ntTSL 27.55□□□□□ -1.21e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.231e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.231e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 MAT2A-204ENST00000469221 691 ntTSL 26.9□□□□□ -1.31e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.351e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 FAM49B-228ENST00000523993 581 ntTSL 36.06□□□□□ -1.441e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 FAM49B-203ENST00000517672 548 ntTSL 54.9□□□□□ -1.631e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.741e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 FAM49B-213ENST00000519142 696 ntTSL 54.13□□□□□ -1.751e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 FAM49B-222ENST00000522702 544 ntTSL 43.9□□□□□ -1.791e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 FAM49B-225ENST00000523288 4552 ntTSL 23.75□□□□□ -1.811e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 CDK19-206ENST00000463016 604 ntTSL 52.78□□□□□ -1.961e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 ARPC2-213ENST00000478612 528 ntTSL 32□□□□□ -2.091e-8■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 CHFR-218ENST00000540963 875 ntTSL 227.47■■□□□ 1.991e-10■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -01e-10■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 CHFR-202ENST00000315585 2446 ntTSL 213.77□□□□□ -0.211e-10■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.281e-10■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.51e-10■■■■■ 28.3
HNRNPKP61978 CHFR-201ENST00000266880 11133 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.681e-10■■■■■ 28.3
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