RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496336.1

ASL-210, Transcript of argininosuccinate lyase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ASL, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASL-210ENST00000496336 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.32■■■■■ 6.45
ASL-210ENST00000496336 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.65■■■■■ 5.54
ASL-210ENST00000496336 ABCC9O60706 1549 aa49.6■■■■■ 5.53
ASL-210ENST00000496336 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.19■■■■■ 5.14
ASL-210ENST00000496336 NACADO15069 1562 aa46.89■■■■■ 5.1
ASL-210ENST00000496336 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.61■■■■■ 5.05
ASL-210ENST00000496336 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.45■■■■■ 5.03
ASL-210ENST00000496336 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.29■■■■■ 5
ASL-210ENST00000496336 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.28■■■■■ 5
ASL-210ENST00000496336 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.14■■■■■ 4.98
ASL-210ENST00000496336 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.97■■■■■ 4.95
ASL-210ENST00000496336 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.89■■■■■ 4.94
ASL-210ENST00000496336 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.71■■■■■ 4.91
ASL-210ENST00000496336 SCRIBQ14160 1630 aa45.23■■■■■ 4.83
ASL-210ENST00000496336 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.22■■■■■ 4.83
ASL-210ENST00000496336 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.85■■■■■ 4.77
ASL-210ENST00000496336 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
ASL-210ENST00000496336 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.66■■■■■ 4.74
ASL-210ENST00000496336 NCAPD3P42695 1498 aa43.31■■■■■ 4.52
ASL-210ENST00000496336 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.19■■■■■ 4.51
ASL-210ENST00000496336 SMARCA4P51532 1647 aa43.17■■■■■ 4.5
ASL-210ENST00000496336 SMARCA2P51531 1590 aa43.01■■■■■ 4.48
ASL-210ENST00000496336 HMGXB3Q12766 1538 aa43■■■■■ 4.47
ASL-210ENST00000496336 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.9■■■■■ 4.46
ASL-210ENST00000496336 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.78■■■■■ 4.44
ASL-210ENST00000496336 ERCC6Q03468 1493 aa42.72■■■■■ 4.43
ASL-210ENST00000496336 CUX2O14529 1486 aa42.71■■■■■ 4.43
ASL-210ENST00000496336 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.71■■■■■ 4.43
ASL-210ENST00000496336 NESP48681 1621 aa42.68■■■■■ 4.42
ASL-210ENST00000496336 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.67■■■■■ 4.42
ASL-210ENST00000496336 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.66■■■■■ 4.42
ASL-210ENST00000496336 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.31■■■■■ 4.36
ASL-210ENST00000496336 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
ASL-210ENST00000496336 WIZO95785 1651 aa42.15■■■■■ 4.34
ASL-210ENST00000496336 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.14■■■■■ 4.34
ASL-210ENST00000496336 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.98■■■■■ 4.31
ASL-210ENST00000496336 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.94■■■■■ 4.3
ASL-210ENST00000496336 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
ASL-210ENST00000496336 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.7■■■■■ 4.27
ASL-210ENST00000496336 WDR62O43379 1518 aa41.65■■■■■ 4.26
ASL-210ENST00000496336 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
ASL-210ENST00000496336 CFTRP13569 1480 aa41.53■■■■■ 4.24
ASL-210ENST00000496336 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.51■■■■■ 4.24
ASL-210ENST00000496336 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.49■■■■■ 4.23
ASL-210ENST00000496336 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
ASL-210ENST00000496336 PRDM2Q13029 1718 aa41.15■■■■■ 4.18
ASL-210ENST00000496336 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.11■■■■■ 4.17
ASL-210ENST00000496336 TOPBP1Q92547 1522 aa40.74■■■■■ 4.11
ASL-210ENST00000496336 TRIM41Q8WV44 630 aa40.71■■■■■ 4.11
ASL-210ENST00000496336 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
ASL-210ENST00000496336 IFT140Q96RY7 1462 aa40.68■■■■■ 4.1
ASL-210ENST00000496336 OSCARQ8IYS5 282 aa40.67■■■■■ 4.1
ASL-210ENST00000496336 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.58■■■■■ 4.09
ASL-210ENST00000496336 ABCC8Q09428 1581 aa40.54■■■■■ 4.08
ASL-210ENST00000496336 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
ASL-210ENST00000496336 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
ASL-210ENST00000496336 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
ASL-210ENST00000496336 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.31■■■■■ 4.04
ASL-210ENST00000496336 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.31■■■■■ 4.04
ASL-210ENST00000496336 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.31■■■■■ 4.04
ASL-210ENST00000496336 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.28■■■■■ 4.04
ASL-210ENST00000496336 CHD1O14646 1710 aa40.19■■■■■ 4.02
ASL-210ENST00000496336 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.19■■■■■ 4.02
ASL-210ENST00000496336 ARHGEF11O15085 1522 aa40.16■■■■■ 4.02
ASL-210ENST00000496336 CUX1P39880 1505 aa40.08■■■■■ 4.01
ASL-210ENST00000496336 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.07■■■■■ 4
ASL-210ENST00000496336 SOGA1O94964 1423 aa40.06■■■■■ 4
ASL-210ENST00000496336 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
ASL-210ENST00000496336 WDR97A6NE52 1622 aa39.94■■■■□ 3.98
ASL-210ENST00000496336 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.88■■■■□ 3.97
ASL-210ENST00000496336 FBLN2P98095 1184 aa39.85■■■■□ 3.97
ASL-210ENST00000496336 ARAP1Q96P48 1450 aa39.8■■■■□ 3.96
ASL-210ENST00000496336 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
ASL-210ENST00000496336 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
ASL-210ENST00000496336 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.74■■■■□ 3.95
ASL-210ENST00000496336 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.74■■■■□ 3.95
ASL-210ENST00000496336 GRIN2BQ13224 1484 aa39.73■■■■□ 3.95
ASL-210ENST00000496336 PBRM1Q86U86 1689 aa39.66■■■■□ 3.94
ASL-210ENST00000496336 SYNJ2O15056 1496 aa39.62■■■■□ 3.93
ASL-210ENST00000496336 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.62■■■■□ 3.93
ASL-210ENST00000496336 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.61■■■■□ 3.93
ASL-210ENST00000496336 SYNJ1O43426 1573 aa39.6■■■■□ 3.93
ASL-210ENST00000496336 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.6■■■■□ 3.93
ASL-210ENST00000496336 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
ASL-210ENST00000496336 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.44■■■■□ 3.9
ASL-210ENST00000496336 TOP2BQ02880 1626 aa39.41■■■■□ 3.9
ASL-210ENST00000496336 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.37■■■■□ 3.89
ASL-210ENST00000496336 ADAMTS12P58397 1594 aa39.29■■■■□ 3.88
ASL-210ENST00000496336 GRIN2AQ12879 1464 aa39.26■■■■□ 3.88
ASL-210ENST00000496336 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.21■■■■□ 3.87
ASL-210ENST00000496336 CEP170Q5SW79 1584 aa39.18■■■■□ 3.86
ASL-210ENST00000496336 NUP160Q12769 1436 aa39.16■■■■□ 3.86
ASL-210ENST00000496336 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.16■■■■□ 3.86
ASL-210ENST00000496336 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.09■■■■□ 3.85
ASL-210ENST00000496336 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.09■■■■□ 3.85
ASL-210ENST00000496336 SHROOM2Q13796 1616 aa39.03■■■■□ 3.84
ASL-210ENST00000496336 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.75■■■■□ 3.79
ASL-210ENST00000496336 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.71■■■■□ 3.79
ASL-210ENST00000496336 JPH4Q96JJ6 628 aa38.64■■■■□ 3.78
ASL-210ENST00000496336 IGF1RP08069 1367 aa38.6■■■■□ 3.77
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