RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557266.5

RCCD1-208, Transcript of RCC1 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RCCD1, Length 2,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1-208ENST00000557266 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.67■■■■■ 5.22
RCCD1-208ENST00000557266 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.44■■■■■ 4.22
RCCD1-208ENST00000557266 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
RCCD1-208ENST00000557266 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.27■■■■■ 4.04
RCCD1-208ENST00000557266 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.89
RCCD1-208ENST00000557266 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.27■■■■□ 3.88
RCCD1-208ENST00000557266 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.22■■■■□ 3.87
RCCD1-208ENST00000557266 ABCC9O60706 1549 aa39.2■■■■□ 3.87
RCCD1-208ENST00000557266 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.81■■■■□ 3.8
RCCD1-208ENST00000557266 NACADO15069 1562 aa38.59■■■■□ 3.77
RCCD1-208ENST00000557266 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.32■■■■□ 3.72
RCCD1-208ENST00000557266 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.29■■■■□ 3.72
RCCD1-208ENST00000557266 SCRIBQ14160 1630 aa38.01■■■■□ 3.68
RCCD1-208ENST00000557266 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.62■■■■□ 3.61
RCCD1-208ENST00000557266 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.58■■■■□ 3.61
RCCD1-208ENST00000557266 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.14■■■■□ 3.54
RCCD1-208ENST00000557266 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.13■■■■□ 3.54
RCCD1-208ENST00000557266 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.07■■■■□ 3.53
RCCD1-208ENST00000557266 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.01■■■■□ 3.52
RCCD1-208ENST00000557266 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.89■■■■□ 3.5
RCCD1-208ENST00000557266 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.82■■■■□ 3.48
RCCD1-208ENST00000557266 WIZO95785 1651 aa36.78■■■■□ 3.48
RCCD1-208ENST00000557266 HRCP23327 699 aa36.78■■■■□ 3.48
RCCD1-208ENST00000557266 TRIM41Q8WV44 630 aa36.76■■■■□ 3.48
RCCD1-208ENST00000557266 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
RCCD1-208ENST00000557266 SMARCA4P51532 1647 aa36.46■■■■□ 3.43
RCCD1-208ENST00000557266 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
RCCD1-208ENST00000557266 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
RCCD1-208ENST00000557266 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
RCCD1-208ENST00000557266 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
RCCD1-208ENST00000557266 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.07■■■■□ 3.37
RCCD1-208ENST00000557266 SMARCA2P51531 1590 aa36.05■■■■□ 3.36
RCCD1-208ENST00000557266 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.05■■■■□ 3.36
RCCD1-208ENST00000557266 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.96■■■■□ 3.35
RCCD1-208ENST00000557266 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
RCCD1-208ENST00000557266 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.86■■■■□ 3.33
RCCD1-208ENST00000557266 ABCC8Q09428 1581 aa35.86■■■■□ 3.33
RCCD1-208ENST00000557266 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
RCCD1-208ENST00000557266 NCAPD3P42695 1498 aa35.59■■■■□ 3.29
RCCD1-208ENST00000557266 HMGXB3Q12766 1538 aa35.57■■■■□ 3.28
RCCD1-208ENST00000557266 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.53■■■■□ 3.28
RCCD1-208ENST00000557266 SOGA1O94964 1423 aa35.49■■■■□ 3.27
RCCD1-208ENST00000557266 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
RCCD1-208ENST00000557266 EEA1Q15075 1411 aa35.38■■■■□ 3.25
RCCD1-208ENST00000557266 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.33■■■■□ 3.25
RCCD1-208ENST00000557266 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.32■■■■□ 3.24
RCCD1-208ENST00000557266 CEP162Q5TB80 1403 aa35.26■■■■□ 3.24
RCCD1-208ENST00000557266 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.26■■■■□ 3.23
RCCD1-208ENST00000557266 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.25■■■■□ 3.23
RCCD1-208ENST00000557266 SYNJ1O43426 1573 aa35.19■■■■□ 3.22
RCCD1-208ENST00000557266 GOLGA3Q08378 1498 aa35.08■■■■□ 3.21
RCCD1-208ENST00000557266 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
RCCD1-208ENST00000557266 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.92■■■■□ 3.18
RCCD1-208ENST00000557266 KIF21BO75037 1637 aa34.91■■■■□ 3.18
RCCD1-208ENST00000557266 TOP2BQ02880 1626 aa34.8■■■■□ 3.16
RCCD1-208ENST00000557266 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
RCCD1-208ENST00000557266 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
RCCD1-208ENST00000557266 CFTRP13569 1480 aa34.76■■■■□ 3.16
RCCD1-208ENST00000557266 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.7■■■■□ 3.14
RCCD1-208ENST00000557266 PRDM2Q13029 1718 aa34.68■■■■□ 3.14
RCCD1-208ENST00000557266 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
RCCD1-208ENST00000557266 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.66■■■■□ 3.14
RCCD1-208ENST00000557266 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.66■■■■□ 3.14
RCCD1-208ENST00000557266 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.64■■■■□ 3.14
RCCD1-208ENST00000557266 CLIP1P30622 1438 aa34.64■■■■□ 3.14
RCCD1-208ENST00000557266 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.5■■■■□ 3.11
RCCD1-208ENST00000557266 CUX1P39880 1505 aa34.49■■■■□ 3.11
RCCD1-208ENST00000557266 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.45■■■■□ 3.1
RCCD1-208ENST00000557266 PRXQ9BXM0 1461 aa34.41■■■■□ 3.1
RCCD1-208ENST00000557266 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.4■■■■□ 3.1
RCCD1-208ENST00000557266 NESP48681 1621 aa34.39■■■■□ 3.1
RCCD1-208ENST00000557266 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.28■■■■□ 3.08
RCCD1-208ENST00000557266 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
RCCD1-208ENST00000557266 KIF27Q86VH2 1401 aa34.26■■■■□ 3.07
RCCD1-208ENST00000557266 APLP2Q06481 763 aa34.19■■■■□ 3.06
RCCD1-208ENST00000557266 ARAP1Q96P48 1450 aa34.16■■■■□ 3.06
RCCD1-208ENST00000557266 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.13■■■■□ 3.05
RCCD1-208ENST00000557266 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
RCCD1-208ENST00000557266 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.04■■■■□ 3.04
RCCD1-208ENST00000557266 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.97■■■■□ 3.03
RCCD1-208ENST00000557266 CUX2O14529 1486 aa33.95■■■■□ 3.02
RCCD1-208ENST00000557266 IGF1RP08069 1367 aa33.9■■■■□ 3.02
RCCD1-208ENST00000557266 TOPBP1Q92547 1522 aa33.9■■■■□ 3.02
RCCD1-208ENST00000557266 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
RCCD1-208ENST00000557266 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.88■■■■□ 3.01
RCCD1-208ENST00000557266 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.88■■■■□ 3.01
RCCD1-208ENST00000557266 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
RCCD1-208ENST00000557266 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
RCCD1-208ENST00000557266 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
RCCD1-208ENST00000557266 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.73■■■□□ 2.99
RCCD1-208ENST00000557266 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
RCCD1-208ENST00000557266 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.71■■■□□ 2.99
RCCD1-208ENST00000557266 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
RCCD1-208ENST00000557266 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
RCCD1-208ENST00000557266 ERCC6Q03468 1493 aa33.64■■■□□ 2.98
RCCD1-208ENST00000557266 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.57■■■□□ 2.96
RCCD1-208ENST00000557266 WDR62O43379 1518 aa33.57■■■□□ 2.96
RCCD1-208ENST00000557266 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.57■■■□□ 2.96
RCCD1-208ENST00000557266 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
RCCD1-208ENST00000557266 WDR97A6NE52 1622 aa33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms