RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556247.1

LRP1-210, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene LRP1, Length 611 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-210ENST00000556247 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.38■■■■□ 3.89
LRP1-210ENST00000556247 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.49■■■■□ 3.11
LRP1-210ENST00000556247 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
LRP1-210ENST00000556247 ABCC9O60706 1549 aa32.91■■■□□ 2.86
LRP1-210ENST00000556247 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.71■■■□□ 2.83
LRP1-210ENST00000556247 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.57■■■□□ 2.8
LRP1-210ENST00000556247 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.31■■■□□ 2.76
LRP1-210ENST00000556247 NACADO15069 1562 aa32.23■■■□□ 2.75
LRP1-210ENST00000556247 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.03■■■□□ 2.72
LRP1-210ENST00000556247 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.9■■■□□ 2.7
LRP1-210ENST00000556247 SCRIBQ14160 1630 aa31.65■■■□□ 2.66
LRP1-210ENST00000556247 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.28■■■□□ 2.6
LRP1-210ENST00000556247 BICRAQ9NZM4 1560 aa31■■■□□ 2.55
LRP1-210ENST00000556247 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.99■■■□□ 2.55
LRP1-210ENST00000556247 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.6■■■□□ 2.49
LRP1-210ENST00000556247 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
LRP1-210ENST00000556247 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
LRP1-210ENST00000556247 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
LRP1-210ENST00000556247 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.39■■■□□ 2.46
LRP1-210ENST00000556247 SMARCA4P51532 1647 aa30.33■■■□□ 2.45
LRP1-210ENST00000556247 WIZO95785 1651 aa30.12■■■□□ 2.41
LRP1-210ENST00000556247 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
LRP1-210ENST00000556247 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.96■■■□□ 2.39
LRP1-210ENST00000556247 SMARCA2P51531 1590 aa29.93■■■□□ 2.38
LRP1-210ENST00000556247 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.93■■■□□ 2.38
LRP1-210ENST00000556247 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
LRP1-210ENST00000556247 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
LRP1-210ENST00000556247 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.75■■■□□ 2.35
LRP1-210ENST00000556247 NCAPD3P42695 1498 aa29.74■■■□□ 2.35
LRP1-210ENST00000556247 HMGXB3Q12766 1538 aa29.65■■■□□ 2.34
LRP1-210ENST00000556247 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.52■■■□□ 2.32
LRP1-210ENST00000556247 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.29■■■□□ 2.28
LRP1-210ENST00000556247 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.1■■■□□ 2.25
LRP1-210ENST00000556247 CFTRP13569 1480 aa28.97■■■□□ 2.23
LRP1-210ENST00000556247 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.97■■■□□ 2.23
LRP1-210ENST00000556247 TRIM41Q8WV44 630 aa28.81■■■□□ 2.2
LRP1-210ENST00000556247 PRDM2Q13029 1718 aa28.79■■■□□ 2.2
LRP1-210ENST00000556247 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.78■■■□□ 2.2
LRP1-210ENST00000556247 NESP48681 1621 aa28.76■■■□□ 2.19
LRP1-210ENST00000556247 ABCC8Q09428 1581 aa28.75■■■□□ 2.19
LRP1-210ENST00000556247 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.67■■■□□ 2.18
LRP1-210ENST00000556247 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.63■■■□□ 2.17
LRP1-210ENST00000556247 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.61■■■□□ 2.17
LRP1-210ENST00000556247 SYNJ1O43426 1573 aa28.5■■■□□ 2.15
LRP1-210ENST00000556247 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.49■■■□□ 2.15
LRP1-210ENST00000556247 TOP2BQ02880 1626 aa28.45■■■□□ 2.14
LRP1-210ENST00000556247 CUX1P39880 1505 aa28.43■■■□□ 2.14
LRP1-210ENST00000556247 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.42■■■□□ 2.14
LRP1-210ENST00000556247 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.4■■■□□ 2.14
LRP1-210ENST00000556247 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.31■■■□□ 2.12
LRP1-210ENST00000556247 ERCC6Q03468 1493 aa28.29■■■□□ 2.12
LRP1-210ENST00000556247 TOPBP1Q92547 1522 aa28.28■■■□□ 2.12
LRP1-210ENST00000556247 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
LRP1-210ENST00000556247 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
LRP1-210ENST00000556247 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.23■■■□□ 2.11
LRP1-210ENST00000556247 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.2■■■□□ 2.1
LRP1-210ENST00000556247 SOGA1O94964 1423 aa28.18■■■□□ 2.1
LRP1-210ENST00000556247 EEA1Q15075 1411 aa28.13■■■□□ 2.09
LRP1-210ENST00000556247 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
LRP1-210ENST00000556247 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.08■■■□□ 2.08
LRP1-210ENST00000556247 WDR62O43379 1518 aa28.05■■■□□ 2.08
LRP1-210ENST00000556247 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.02■■■□□ 2.08
LRP1-210ENST00000556247 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
LRP1-210ENST00000556247 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.02■■■□□ 2.08
LRP1-210ENST00000556247 KIF27Q86VH2 1401 aa28■■■□□ 2.07
LRP1-210ENST00000556247 CUX2O14529 1486 aa27.98■■■□□ 2.07
LRP1-210ENST00000556247 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.96■■■□□ 2.07
LRP1-210ENST00000556247 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.95■■■□□ 2.06
LRP1-210ENST00000556247 IFT140Q96RY7 1462 aa27.85■■■□□ 2.05
LRP1-210ENST00000556247 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
LRP1-210ENST00000556247 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.84■■■□□ 2.05
LRP1-210ENST00000556247 WDR97A6NE52 1622 aa27.83■■■□□ 2.05
LRP1-210ENST00000556247 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
LRP1-210ENST00000556247 IGF1RP08069 1367 aa27.77■■■□□ 2.04
LRP1-210ENST00000556247 KIF21BO75037 1637 aa27.73■■■□□ 2.03
LRP1-210ENST00000556247 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.72■■■□□ 2.03
LRP1-210ENST00000556247 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.71■■■□□ 2.03
LRP1-210ENST00000556247 GOLGA3Q08378 1498 aa27.7■■■□□ 2.03
LRP1-210ENST00000556247 PRXQ9BXM0 1461 aa27.69■■■□□ 2.02
LRP1-210ENST00000556247 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.65■■■□□ 2.022e-6■■■■■ 43.8
LRP1-210ENST00000556247 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
LRP1-210ENST00000556247 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
LRP1-210ENST00000556247 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.64■■■□□ 2.02
LRP1-210ENST00000556247 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.63■■■□□ 2.01
LRP1-210ENST00000556247 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.61■■■□□ 2.01
LRP1-210ENST00000556247 GRIN2BQ13224 1484 aa27.57■■■□□ 2
LRP1-210ENST00000556247 CUL7Q14999 1698 aa27.57■■■□□ 2
LRP1-210ENST00000556247 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.57■■■□□ 2
LRP1-210ENST00000556247 PBRM1Q86U86 1689 aa27.56■■■□□ 2
LRP1-210ENST00000556247 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
LRP1-210ENST00000556247 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.44■■□□□ 1.98
LRP1-210ENST00000556247 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.39■■□□□ 1.98
LRP1-210ENST00000556247 ADAMTS12P58397 1594 aa27.39■■□□□ 1.97
LRP1-210ENST00000556247 CEP162Q5TB80 1403 aa27.36■■□□□ 1.97
LRP1-210ENST00000556247 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
LRP1-210ENST00000556247 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
LRP1-210ENST00000556247 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
LRP1-210ENST00000556247 SYNJ2O15056 1496 aa27.25■■□□□ 1.95
LRP1-210ENST00000556247 CLIP1P30622 1438 aa27.24■■□□□ 1.95
LRP1-210ENST00000556247 FBLN2P98095 1184 aa27.23■■□□□ 1.95
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