RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.7■■■■■ 4.75
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.74■■■■□ 3.95
PTPRK-218ENST00000525459 ABCC9O60706 1549 aa38.13■■■■□ 3.7
PTPRK-218ENST00000525459 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
PTPRK-218ENST00000525459 NACADO15069 1562 aa37.15■■■■□ 3.54
PTPRK-218ENST00000525459 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.13■■■■□ 3.53
PTPRK-218ENST00000525459 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.12■■■■□ 3.53
PTPRK-218ENST00000525459 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.08■■■■□ 3.53
PTPRK-218ENST00000525459 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.91■■■■□ 3.5
PTPRK-218ENST00000525459 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.29■■■■□ 3.4
PTPRK-218ENST00000525459 SCRIBQ14160 1630 aa36.11■■■■□ 3.37
PTPRK-218ENST00000525459 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.85■■■■□ 3.33
PTPRK-218ENST00000525459 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.7■■■■□ 3.31
PTPRK-218ENST00000525459 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.57■■■■□ 3.29
PTPRK-218ENST00000525459 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
PTPRK-218ENST00000525459 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
PTPRK-218ENST00000525459 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.65■■■■□ 3.14
PTPRK-218ENST00000525459 SMARCA4P51532 1647 aa34.65■■■■□ 3.14
PTPRK-218ENST00000525459 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.62■■■■□ 3.13
PTPRK-218ENST00000525459 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.4■■■■□ 3.1
PTPRK-218ENST00000525459 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.38■■■■□ 3.09
PTPRK-218ENST00000525459 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.35■■■■□ 3.09
PTPRK-218ENST00000525459 SMARCA2P51531 1590 aa34.34■■■■□ 3.09
PTPRK-218ENST00000525459 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.25■■■■□ 3.07
PTPRK-218ENST00000525459 NCAPD3P42695 1498 aa34.19■■■■□ 3.06
PTPRK-218ENST00000525459 HMGXB3Q12766 1538 aa34.17■■■■□ 3.06
PTPRK-218ENST00000525459 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
PTPRK-218ENST00000525459 WIZO95785 1651 aa34.11■■■■□ 3.05
PTPRK-218ENST00000525459 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
PTPRK-218ENST00000525459 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
PTPRK-218ENST00000525459 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.51■■■□□ 2.96
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.31■■■□□ 2.92
PTPRK-218ENST00000525459 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.31■■■□□ 2.92
PTPRK-218ENST00000525459 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.17■■■□□ 2.9
PTPRK-218ENST00000525459 PRDM2Q13029 1718 aa33.17■■■□□ 2.9
PTPRK-218ENST00000525459 CFTRP13569 1480 aa33.12■■■□□ 2.89
PTPRK-218ENST00000525459 NESP48681 1621 aa33.12■■■□□ 2.89
PTPRK-218ENST00000525459 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.98■■■□□ 2.87
PTPRK-218ENST00000525459 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.92■■■□□ 2.86
PTPRK-218ENST00000525459 ERCC6Q03468 1493 aa32.9■■■□□ 2.86
PTPRK-218ENST00000525459 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.82■■■□□ 2.84
PTPRK-218ENST00000525459 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.78■■■□□ 2.84
PTPRK-218ENST00000525459 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
PTPRK-218ENST00000525459 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.62■■■□□ 2.81
PTPRK-218ENST00000525459 WDR62O43379 1518 aa32.54■■■□□ 2.8
PTPRK-218ENST00000525459 ABCC8Q09428 1581 aa32.48■■■□□ 2.79
PTPRK-218ENST00000525459 CUX2O14529 1486 aa32.46■■■□□ 2.79
PTPRK-218ENST00000525459 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
PTPRK-218ENST00000525459 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.44■■■□□ 2.78
PTPRK-218ENST00000525459 TOPBP1Q92547 1522 aa32.36■■■□□ 2.77
PTPRK-218ENST00000525459 CUX1P39880 1505 aa32.26■■■□□ 2.76
PTPRK-218ENST00000525459 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.25■■■□□ 2.75
PTPRK-218ENST00000525459 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.25■■■□□ 2.75
PTPRK-218ENST00000525459 TOP2BQ02880 1626 aa32.22■■■□□ 2.75
PTPRK-218ENST00000525459 SYNJ1O43426 1573 aa32.16■■■□□ 2.74
PTPRK-218ENST00000525459 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
PTPRK-218ENST00000525459 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.1■■■□□ 2.73
PTPRK-218ENST00000525459 IFT140Q96RY7 1462 aa32.07■■■□□ 2.72
PTPRK-218ENST00000525459 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
PTPRK-218ENST00000525459 WDR97A6NE52 1622 aa31.95■■■□□ 2.71
PTPRK-218ENST00000525459 SOGA1O94964 1423 aa31.94■■■□□ 2.7
PTPRK-218ENST00000525459 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.88■■■□□ 2.69
PTPRK-218ENST00000525459 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.85■■■□□ 2.69
PTPRK-218ENST00000525459 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
PTPRK-218ENST00000525459 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.74■■■□□ 2.67
PTPRK-218ENST00000525459 TRIM41Q8WV44 630 aa31.72■■■□□ 2.67
PTPRK-218ENST00000525459 PBRM1Q86U86 1689 aa31.67■■■□□ 2.66
PTPRK-218ENST00000525459 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.63■■■□□ 2.659e-8■■■■■ 30.5
PTPRK-218ENST00000525459 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
PTPRK-218ENST00000525459 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.63■■■□□ 2.65
PTPRK-218ENST00000525459 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.58■■■□□ 2.65
PTPRK-218ENST00000525459 GRIN2BQ13224 1484 aa31.58■■■□□ 2.65
PTPRK-218ENST00000525459 KIF27Q86VH2 1401 aa31.56■■■□□ 2.64
PTPRK-218ENST00000525459 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.53■■■□□ 2.64
PTPRK-218ENST00000525459 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
PTPRK-218ENST00000525459 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.43■■■□□ 2.62
PTPRK-218ENST00000525459 CUL7Q14999 1698 aa31.41■■■□□ 2.62
PTPRK-218ENST00000525459 ADAMTS12P58397 1594 aa31.38■■■□□ 2.61
PTPRK-218ENST00000525459 CHD1O14646 1710 aa31.36■■■□□ 2.61
PTPRK-218ENST00000525459 EEA1Q15075 1411 aa31.34■■■□□ 2.61
PTPRK-218ENST00000525459 SYNJ2O15056 1496 aa31.33■■■□□ 2.61
PTPRK-218ENST00000525459 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.29■■■□□ 2.6
PTPRK-218ENST00000525459 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.27■■■□□ 2.6
PTPRK-218ENST00000525459 IGF1RP08069 1367 aa31.27■■■□□ 2.6
PTPRK-218ENST00000525459 GRIN2AQ12879 1464 aa31.17■■■□□ 2.58
PTPRK-218ENST00000525459 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
PTPRK-218ENST00000525459 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.12■■■□□ 2.57
PTPRK-218ENST00000525459 FBLN2P98095 1184 aa31.11■■■□□ 2.57
PTPRK-218ENST00000525459 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.06■■■□□ 2.56
PTPRK-218ENST00000525459 PRXQ9BXM0 1461 aa31.05■■■□□ 2.56
PTPRK-218ENST00000525459 OSCARQ8IYS5 282 aa31.05■■■□□ 2.56
PTPRK-218ENST00000525459 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.04■■■□□ 2.56
PTPRK-218ENST00000525459 NUP160Q12769 1436 aa31.01■■■□□ 2.55
PTPRK-218ENST00000525459 KIF21BO75037 1637 aa31■■■□□ 2.55
PTPRK-218ENST00000525459 CEP170Q5SW79 1584 aa30.99■■■□□ 2.55
PTPRK-218ENST00000525459 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.97■■■□□ 2.55
PTPRK-218ENST00000525459 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
PTPRK-218ENST00000525459 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.91■■■□□ 2.54
PTPRK-218ENST00000525459 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.83■■■□□ 2.53
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