Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
IQGAP1P46940 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
IQGAP1P46940 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
IQGAP1P46940 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
IQGAP1P46940 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.08
IQGAP1P46940 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
IQGAP1P46940 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
IQGAP1P46940 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
IQGAP1P46940 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
IQGAP1P46940 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
IQGAP1P46940 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
IQGAP1P46940 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
IQGAP1P46940 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
IQGAP1P46940 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
IQGAP1P46940 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
IQGAP1P46940 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
IQGAP1P46940 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
IQGAP1P46940 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
IQGAP1P46940 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
IQGAP1P46940 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
IQGAP1P46940 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
IQGAP1P46940 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
IQGAP1P46940 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
IQGAP1P46940 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
IQGAP1P46940 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
IQGAP1P46940 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
IQGAP1P46940 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
IQGAP1P46940 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
IQGAP1P46940 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
IQGAP1P46940 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
IQGAP1P46940 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
IQGAP1P46940 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
IQGAP1P46940 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
IQGAP1P46940 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
IQGAP1P46940 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
IQGAP1P46940 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
IQGAP1P46940 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
IQGAP1P46940 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
IQGAP1P46940 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
IQGAP1P46940 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
IQGAP1P46940 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms