Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APCP25054 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APCP25054 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APCP25054 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APCP25054 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APCP25054 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APCP25054 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APCP25054 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APCP25054 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APCP25054 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APCP25054 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APCP25054 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APCP25054 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APCP25054 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APCP25054 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APCP25054 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APCP25054 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APCP25054 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APCP25054 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APCP25054 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APCP25054 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APCP25054 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APCP25054 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APCP25054 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APCP25054 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APCP25054 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APCP25054 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APCP25054 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APCP25054 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APCP25054 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APCP25054 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APCP25054 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APCP25054 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APCP25054 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APCP25054 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APCP25054 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APCP25054 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APCP25054 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APCP25054 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APCP25054 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APCP25054 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APCP25054 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
APCP25054 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
APCP25054 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
APCP25054 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APCP25054 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APCP25054 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APCP25054 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APCP25054 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APCP25054 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APCP25054 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APCP25054 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APCP25054 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APCP25054 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APCP25054 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APCP25054 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APCP25054 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APCP25054 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APCP25054 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APCP25054 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APCP25054 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APCP25054 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APCP25054 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APCP25054 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APCP25054 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APCP25054 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APCP25054 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APCP25054 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APCP25054 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APCP25054 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APCP25054 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APCP25054 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APCP25054 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APCP25054 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APCP25054 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APCP25054 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APCP25054 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APCP25054 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APCP25054 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APCP25054 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APCP25054 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APCP25054 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APCP25054 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APCP25054 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APCP25054 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APCP25054 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APCP25054 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APCP25054 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APCP25054 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APCP25054 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APCP25054 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APCP25054 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APCP25054 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APCP25054 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
APCP25054 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APCP25054 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APCP25054 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APCP25054 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APCP25054 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APCP25054 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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