Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSO75390 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSO75390 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSO75390 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSO75390 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSO75390 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSO75390 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSO75390 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSO75390 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSO75390 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSO75390 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSO75390 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSO75390 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSO75390 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSO75390 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSO75390 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSO75390 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSO75390 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSO75390 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSO75390 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSO75390 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSO75390 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSO75390 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSO75390 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSO75390 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSO75390 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSO75390 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSO75390 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSO75390 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSO75390 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSO75390 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSO75390 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSO75390 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSO75390 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSO75390 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSO75390 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSO75390 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSO75390 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSO75390 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSO75390 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSO75390 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSO75390 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSO75390 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSO75390 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSO75390 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSO75390 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSO75390 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSO75390 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSO75390 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSO75390 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSO75390 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSO75390 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSO75390 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSO75390 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSO75390 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSO75390 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSO75390 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSO75390 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSO75390 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSO75390 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSO75390 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSO75390 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSO75390 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSO75390 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSO75390 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSO75390 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSO75390 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSO75390 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSO75390 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSO75390 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSO75390 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSO75390 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSO75390 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSO75390 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSO75390 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSO75390 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSO75390 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSO75390 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSO75390 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSO75390 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSO75390 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSO75390 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSO75390 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSO75390 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSO75390 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSO75390 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSO75390 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSO75390 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSO75390 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSO75390 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSO75390 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSO75390 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSO75390 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSO75390 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSO75390 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSO75390 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSO75390 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSO75390 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSO75390 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSO75390 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms