RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400151.6

PCGF3-202, Transcript of polycomb group ring finger 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PCGF3, Length 1,175 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3-202ENST00000400151 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.27■■■■■ 6.6
PCGF3-202ENST00000400151 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.44■■■■■ 5.66
PCGF3-202ENST00000400151 ABCC9O60706 1549 aa50.43■■■■■ 5.66
PCGF3-202ENST00000400151 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.05■■■■■ 5.28
PCGF3-202ENST00000400151 NACADO15069 1562 aa47.77■■■■■ 5.24
PCGF3-202ENST00000400151 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.56■■■■■ 5.2
PCGF3-202ENST00000400151 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.41■■■■■ 5.18
PCGF3-202ENST00000400151 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.17■■■■■ 5.14
PCGF3-202ENST00000400151 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.03■■■■■ 5.12
PCGF3-202ENST00000400151 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.83■■■■■ 5.09
PCGF3-202ENST00000400151 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.6■■■■■ 5.05
PCGF3-202ENST00000400151 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.58■■■■■ 5.05
PCGF3-202ENST00000400151 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.54■■■■■ 5.04
PCGF3-202ENST00000400151 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.09■■■■■ 4.97
PCGF3-202ENST00000400151 SCRIBQ14160 1630 aa45.88■■■■■ 4.93
PCGF3-202ENST00000400151 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.55■■■■■ 4.88
PCGF3-202ENST00000400151 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.48■■■■■ 4.87
PCGF3-202ENST00000400151 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.47■■■■■ 4.87
PCGF3-202ENST00000400151 NCAPD3P42695 1498 aa44.15■■■■■ 4.66
PCGF3-202ENST00000400151 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.95■■■■■ 4.63
PCGF3-202ENST00000400151 SMARCA4P51532 1647 aa43.83■■■■■ 4.61
PCGF3-202ENST00000400151 SMARCA2P51531 1590 aa43.83■■■■■ 4.61
PCGF3-202ENST00000400151 HMGXB3Q12766 1538 aa43.72■■■■■ 4.59
PCGF3-202ENST00000400151 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.67■■■■■ 4.58
PCGF3-202ENST00000400151 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.64■■■■■ 4.58
PCGF3-202ENST00000400151 ERCC6Q03468 1493 aa43.57■■■■■ 4.57
PCGF3-202ENST00000400151 CUX2O14529 1486 aa43.55■■■■■ 4.56
PCGF3-202ENST00000400151 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
PCGF3-202ENST00000400151 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.46■■■■■ 4.55
PCGF3-202ENST00000400151 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.31■■■■■ 4.52
PCGF3-202ENST00000400151 NESP48681 1621 aa43.3■■■■■ 4.52
PCGF3-202ENST00000400151 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.07■■■■■ 4.49
PCGF3-202ENST00000400151 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.9■■■■■ 4.46
PCGF3-202ENST00000400151 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.45
PCGF3-202ENST00000400151 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.8■■■■■ 4.44
PCGF3-202ENST00000400151 WIZO95785 1651 aa42.73■■■■■ 4.43
PCGF3-202ENST00000400151 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.68■■■■■ 4.42
PCGF3-202ENST00000400151 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.48■■■■■ 4.39
PCGF3-202ENST00000400151 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.44■■■■■ 4.38
PCGF3-202ENST00000400151 WDR62O43379 1518 aa42.31■■■■■ 4.36
PCGF3-202ENST00000400151 CFTRP13569 1480 aa42.28■■■■■ 4.36
PCGF3-202ENST00000400151 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.28■■■■■ 4.36
PCGF3-202ENST00000400151 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
PCGF3-202ENST00000400151 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.23■■■■■ 4.35
PCGF3-202ENST00000400151 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
PCGF3-202ENST00000400151 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.82■■■■■ 4.29
PCGF3-202ENST00000400151 PRDM2Q13029 1718 aa41.7■■■■■ 4.27
PCGF3-202ENST00000400151 OSCARQ8IYS5 282 aa41.69■■■■■ 4.26
PCGF3-202ENST00000400151 TRIM41Q8WV44 630 aa41.59■■■■■ 4.25
PCGF3-202ENST00000400151 IFT140Q96RY7 1462 aa41.47■■■■■ 4.23
PCGF3-202ENST00000400151 ABCC8Q09428 1581 aa41.46■■■■■ 4.23
PCGF3-202ENST00000400151 TOPBP1Q92547 1522 aa41.43■■■■■ 4.22
PCGF3-202ENST00000400151 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
PCGF3-202ENST00000400151 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.25■■■■■ 4.19
PCGF3-202ENST00000400151 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
PCGF3-202ENST00000400151 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
PCGF3-202ENST00000400151 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.01■■■■■ 4.164e-23■■■■■ 37.7
PCGF3-202ENST00000400151 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
PCGF3-202ENST00000400151 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.92■■■■■ 4.14
PCGF3-202ENST00000400151 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.92■■■■■ 4.14
PCGF3-202ENST00000400151 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.92■■■■■ 4.14
PCGF3-202ENST00000400151 SOGA1O94964 1423 aa40.9■■■■■ 4.14
PCGF3-202ENST00000400151 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.83■■■■■ 4.13
PCGF3-202ENST00000400151 ARHGEF11O15085 1522 aa40.82■■■■■ 4.12
PCGF3-202ENST00000400151 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
PCGF3-202ENST00000400151 FBLN2P98095 1184 aa40.78■■■■■ 4.12
PCGF3-202ENST00000400151 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.72■■■■■ 4.11
PCGF3-202ENST00000400151 CHD1O14646 1710 aa40.72■■■■■ 4.11
PCGF3-202ENST00000400151 CUX1P39880 1505 aa40.68■■■■■ 4.1
PCGF3-202ENST00000400151 WDR97A6NE52 1622 aa40.67■■■■■ 4.1
PCGF3-202ENST00000400151 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.65■■■■■ 4.1
PCGF3-202ENST00000400151 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
PCGF3-202ENST00000400151 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
PCGF3-202ENST00000400151 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.53■■■■■ 4.08
PCGF3-202ENST00000400151 GRIN2BQ13224 1484 aa40.51■■■■■ 4.07
PCGF3-202ENST00000400151 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.07
PCGF3-202ENST00000400151 ARAP1Q96P48 1450 aa40.41■■■■■ 4.06
PCGF3-202ENST00000400151 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.37■■■■■ 4.05
PCGF3-202ENST00000400151 SYNJ2O15056 1496 aa40.36■■■■■ 4.05
PCGF3-202ENST00000400151 SYNJ1O43426 1573 aa40.33■■■■■ 4.05
PCGF3-202ENST00000400151 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.32■■■■■ 4.05
PCGF3-202ENST00000400151 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.32■■■■■ 4.04
PCGF3-202ENST00000400151 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.21■■■■■ 4.036e-6■■■■■ 35.2
PCGF3-202ENST00000400151 PBRM1Q86U86 1689 aa40.19■■■■■ 4.02
PCGF3-202ENST00000400151 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
PCGF3-202ENST00000400151 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.16■■■■■ 4.02
PCGF3-202ENST00000400151 TOP2BQ02880 1626 aa40.05■■■■■ 4
PCGF3-202ENST00000400151 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.02■■■■■ 4
PCGF3-202ENST00000400151 GRIN2AQ12879 1464 aa39.95■■■■□ 3.99
PCGF3-202ENST00000400151 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.88■■■■□ 3.97
PCGF3-202ENST00000400151 NUP160Q12769 1436 aa39.85■■■■□ 3.97
PCGF3-202ENST00000400151 ADAMTS12P58397 1594 aa39.84■■■■□ 3.97
PCGF3-202ENST00000400151 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.81■■■■□ 3.96
PCGF3-202ENST00000400151 CEP170Q5SW79 1584 aa39.74■■■■□ 3.95
PCGF3-202ENST00000400151 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.65■■■■□ 3.94
PCGF3-202ENST00000400151 SHROOM2Q13796 1616 aa39.61■■■■□ 3.93
PCGF3-202ENST00000400151 JPH4Q96JJ6 628 aa39.55■■■■□ 3.92
PCGF3-202ENST00000400151 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.47■■■■□ 3.91
PCGF3-202ENST00000400151 IGF1RP08069 1367 aa39.38■■■■□ 3.89
PCGF3-202ENST00000400151 KIF27Q86VH2 1401 aa39.35■■■■□ 3.89
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