Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DENRO43583 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DENRO43583 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DENRO43583 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DENRO43583 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DENRO43583 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DENRO43583 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DENRO43583 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DENRO43583 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DENRO43583 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DENRO43583 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DENRO43583 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DENRO43583 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DENRO43583 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DENRO43583 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DENRO43583 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DENRO43583 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DENRO43583 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DENRO43583 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DENRO43583 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DENRO43583 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DENRO43583 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DENRO43583 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DENRO43583 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DENRO43583 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DENRO43583 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DENRO43583 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DENRO43583 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DENRO43583 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DENRO43583 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DENRO43583 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DENRO43583 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DENRO43583 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DENRO43583 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DENRO43583 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DENRO43583 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DENRO43583 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DENRO43583 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DENRO43583 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DENRO43583 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DENRO43583 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DENRO43583 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DENRO43583 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DENRO43583 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DENRO43583 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DENRO43583 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DENRO43583 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DENRO43583 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DENRO43583 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DENRO43583 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DENRO43583 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DENRO43583 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DENRO43583 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DENRO43583 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DENRO43583 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DENRO43583 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DENRO43583 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DENRO43583 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DENRO43583 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DENRO43583 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DENRO43583 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DENRO43583 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DENRO43583 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DENRO43583 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DENRO43583 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DENRO43583 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DENRO43583 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DENRO43583 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DENRO43583 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DENRO43583 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DENRO43583 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DENRO43583 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DENRO43583 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DENRO43583 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DENRO43583 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DENRO43583 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DENRO43583 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DENRO43583 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DENRO43583 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DENRO43583 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DENRO43583 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DENRO43583 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DENRO43583 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DENRO43583 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DENRO43583 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DENRO43583 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DENRO43583 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DENRO43583 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DENRO43583 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DENRO43583 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DENRO43583 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DENRO43583 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DENRO43583 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DENRO43583 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DENRO43583 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DENRO43583 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DENRO43583 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DENRO43583 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DENRO43583 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DENRO43583 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms