Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGPEP1LA6NFU8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGPEP1LA6NFU8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGPEP1LA6NFU8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGPEP1LA6NFU8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGPEP1LA6NFU8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGPEP1LA6NFU8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGPEP1LA6NFU8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGPEP1LA6NFU8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGPEP1LA6NFU8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGPEP1LA6NFU8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PGPEP1LA6NFU8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGPEP1LA6NFU8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGPEP1LA6NFU8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGPEP1LA6NFU8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGPEP1LA6NFU8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms