Protein–RNA interactions for Protein: A2VCK2

DCDC2B, Doublecortin domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2BA2VCK2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DCDC2BA2VCK2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCDC2BA2VCK2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCDC2BA2VCK2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCDC2BA2VCK2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCDC2BA2VCK2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCDC2BA2VCK2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCDC2BA2VCK2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCDC2BA2VCK2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCDC2BA2VCK2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DCDC2BA2VCK2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCDC2BA2VCK2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DCDC2BA2VCK2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCDC2BA2VCK2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCDC2BA2VCK2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCDC2BA2VCK2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCDC2BA2VCK2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCDC2BA2VCK2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms