Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SNX11Q9Y5W9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SNX11Q9Y5W9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SNX11Q9Y5W9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SNX11Q9Y5W9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNX11Q9Y5W9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX11Q9Y5W9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX11Q9Y5W9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX11Q9Y5W9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNX11Q9Y5W9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNX11Q9Y5W9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNX11Q9Y5W9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNX11Q9Y5W9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX11Q9Y5W9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX11Q9Y5W9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX11Q9Y5W9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX11Q9Y5W9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNX11Q9Y5W9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX11Q9Y5W9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX11Q9Y5W9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNX11Q9Y5W9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNX11Q9Y5W9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX11Q9Y5W9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX11Q9Y5W9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX11Q9Y5W9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX11Q9Y5W9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX11Q9Y5W9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX11Q9Y5W9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX11Q9Y5W9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX11Q9Y5W9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX11Q9Y5W9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX11Q9Y5W9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNX11Q9Y5W9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNX11Q9Y5W9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX11Q9Y5W9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNX11Q9Y5W9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNX11Q9Y5W9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNX11Q9Y5W9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX11Q9Y5W9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX11Q9Y5W9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX11Q9Y5W9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNX11Q9Y5W9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNX11Q9Y5W9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNX11Q9Y5W9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNX11Q9Y5W9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX11Q9Y5W9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX11Q9Y5W9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX11Q9Y5W9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX11Q9Y5W9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX11Q9Y5W9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX11Q9Y5W9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX11Q9Y5W9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX11Q9Y5W9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX11Q9Y5W9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX11Q9Y5W9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX11Q9Y5W9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX11Q9Y5W9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX11Q9Y5W9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX11Q9Y5W9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX11Q9Y5W9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX11Q9Y5W9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX11Q9Y5W9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX11Q9Y5W9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX11Q9Y5W9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SNX11Q9Y5W9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX11Q9Y5W9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX11Q9Y5W9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX11Q9Y5W9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX11Q9Y5W9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX11Q9Y5W9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX11Q9Y5W9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SNX11Q9Y5W9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX11Q9Y5W9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX11Q9Y5W9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX11Q9Y5W9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX11Q9Y5W9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX11Q9Y5W9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX11Q9Y5W9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX11Q9Y5W9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX11Q9Y5W9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX11Q9Y5W9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
SNX11Q9Y5W9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX11Q9Y5W9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX11Q9Y5W9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX11Q9Y5W9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX11Q9Y5W9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX11Q9Y5W9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX11Q9Y5W9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX11Q9Y5W9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX11Q9Y5W9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX11Q9Y5W9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX11Q9Y5W9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX11Q9Y5W9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX11Q9Y5W9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX11Q9Y5W9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SNX11Q9Y5W9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX11Q9Y5W9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX11Q9Y5W9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX11Q9Y5W9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX11Q9Y5W9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms