Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APOBEC2Q9Y235 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOBEC2Q9Y235 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOBEC2Q9Y235 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOBEC2Q9Y235 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOBEC2Q9Y235 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOBEC2Q9Y235 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBEC2Q9Y235 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APOBEC2Q9Y235 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APOBEC2Q9Y235 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APOBEC2Q9Y235 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
APOBEC2Q9Y235 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOBEC2Q9Y235 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APOBEC2Q9Y235 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
APOBEC2Q9Y235 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOBEC2Q9Y235 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
APOBEC2Q9Y235 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOBEC2Q9Y235 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOBEC2Q9Y235 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBEC2Q9Y235 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBEC2Q9Y235 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBEC2Q9Y235 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APOBEC2Q9Y235 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
APOBEC2Q9Y235 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APOBEC2Q9Y235 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APOBEC2Q9Y235 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOBEC2Q9Y235 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOBEC2Q9Y235 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOBEC2Q9Y235 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
APOBEC2Q9Y235 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
APOBEC2Q9Y235 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
APOBEC2Q9Y235 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOBEC2Q9Y235 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOBEC2Q9Y235 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
APOBEC2Q9Y235 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APOBEC2Q9Y235 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
APOBEC2Q9Y235 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOBEC2Q9Y235 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APOBEC2Q9Y235 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
APOBEC2Q9Y235 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
APOBEC2Q9Y235 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APOBEC2Q9Y235 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
APOBEC2Q9Y235 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
APOBEC2Q9Y235 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
APOBEC2Q9Y235 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
APOBEC2Q9Y235 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
APOBEC2Q9Y235 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APOBEC2Q9Y235 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOBEC2Q9Y235 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOBEC2Q9Y235 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APOBEC2Q9Y235 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APOBEC2Q9Y235 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APOBEC2Q9Y235 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
APOBEC2Q9Y235 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APOBEC2Q9Y235 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOBEC2Q9Y235 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
APOBEC2Q9Y235 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOBEC2Q9Y235 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
APOBEC2Q9Y235 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOBEC2Q9Y235 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOBEC2Q9Y235 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOBEC2Q9Y235 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOBEC2Q9Y235 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOBEC2Q9Y235 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
APOBEC2Q9Y235 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
APOBEC2Q9Y235 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
APOBEC2Q9Y235 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
APOBEC2Q9Y235 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
APOBEC2Q9Y235 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
APOBEC2Q9Y235 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
APOBEC2Q9Y235 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
APOBEC2Q9Y235 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
APOBEC2Q9Y235 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOBEC2Q9Y235 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOBEC2Q9Y235 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOBEC2Q9Y235 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
APOBEC2Q9Y235 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
APOBEC2Q9Y235 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBEC2Q9Y235 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBEC2Q9Y235 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOBEC2Q9Y235 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOBEC2Q9Y235 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOBEC2Q9Y235 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOBEC2Q9Y235 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBEC2Q9Y235 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBEC2Q9Y235 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBEC2Q9Y235 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBEC2Q9Y235 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APOBEC2Q9Y235 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
APOBEC2Q9Y235 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
APOBEC2Q9Y235 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APOBEC2Q9Y235 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
APOBEC2Q9Y235 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBEC2Q9Y235 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBEC2Q9Y235 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOBEC2Q9Y235 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APOBEC2Q9Y235 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APOBEC2Q9Y235 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
APOBEC2Q9Y235 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
APOBEC2Q9Y235 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms