Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00474Q9P2X8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00474Q9P2X8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00474Q9P2X8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00474Q9P2X8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00474Q9P2X8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00474Q9P2X8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00474Q9P2X8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00474Q9P2X8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00474Q9P2X8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00474Q9P2X8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00474Q9P2X8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00474Q9P2X8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00474Q9P2X8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00474Q9P2X8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00474Q9P2X8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00474Q9P2X8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00474Q9P2X8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00474Q9P2X8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00474Q9P2X8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00474Q9P2X8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00474Q9P2X8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00474Q9P2X8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00474Q9P2X8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00474Q9P2X8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00474Q9P2X8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00474Q9P2X8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00474Q9P2X8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00474Q9P2X8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00474Q9P2X8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00474Q9P2X8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00474Q9P2X8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00474Q9P2X8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00474Q9P2X8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00474Q9P2X8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00474Q9P2X8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00474Q9P2X8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00474Q9P2X8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00474Q9P2X8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00474Q9P2X8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00474Q9P2X8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00474Q9P2X8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00474Q9P2X8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00474Q9P2X8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00474Q9P2X8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00474Q9P2X8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00474Q9P2X8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00474Q9P2X8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00474Q9P2X8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00474Q9P2X8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00474Q9P2X8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00474Q9P2X8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00474Q9P2X8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00474Q9P2X8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00474Q9P2X8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00474Q9P2X8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00474Q9P2X8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00474Q9P2X8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00474Q9P2X8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00474Q9P2X8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00474Q9P2X8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00474Q9P2X8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00474Q9P2X8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00474Q9P2X8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00474Q9P2X8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00474Q9P2X8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00474Q9P2X8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00474Q9P2X8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00474Q9P2X8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00474Q9P2X8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00474Q9P2X8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00474Q9P2X8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00474Q9P2X8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00474Q9P2X8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00474Q9P2X8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00474Q9P2X8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00474Q9P2X8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00474Q9P2X8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00474Q9P2X8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00474Q9P2X8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00474Q9P2X8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00474Q9P2X8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00474Q9P2X8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00474Q9P2X8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00474Q9P2X8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00474Q9P2X8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00474Q9P2X8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00474Q9P2X8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00474Q9P2X8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00474Q9P2X8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00474Q9P2X8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00474Q9P2X8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00474Q9P2X8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00474Q9P2X8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00474Q9P2X8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00474Q9P2X8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00474Q9P2X8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00474Q9P2X8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00474Q9P2X8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00474Q9P2X8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms