Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZP8

C1RL, Complement C1r subcomponent-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RLQ9NZP8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1RLQ9NZP8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1RLQ9NZP8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1RLQ9NZP8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1RLQ9NZP8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1RLQ9NZP8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C1RLQ9NZP8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1RLQ9NZP8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1RLQ9NZP8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1RLQ9NZP8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1RLQ9NZP8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1RLQ9NZP8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1RLQ9NZP8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1RLQ9NZP8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1RLQ9NZP8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1RLQ9NZP8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1RLQ9NZP8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1RLQ9NZP8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1RLQ9NZP8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
C1RLQ9NZP8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1RLQ9NZP8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1RLQ9NZP8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C1RLQ9NZP8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1RLQ9NZP8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1RLQ9NZP8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1RLQ9NZP8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1RLQ9NZP8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1RLQ9NZP8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C1RLQ9NZP8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1RLQ9NZP8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1RLQ9NZP8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1RLQ9NZP8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1RLQ9NZP8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1RLQ9NZP8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1RLQ9NZP8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1RLQ9NZP8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1RLQ9NZP8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1RLQ9NZP8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1RLQ9NZP8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1RLQ9NZP8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1RLQ9NZP8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1RLQ9NZP8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1RLQ9NZP8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1RLQ9NZP8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1RLQ9NZP8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1RLQ9NZP8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1RLQ9NZP8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1RLQ9NZP8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1RLQ9NZP8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1RLQ9NZP8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1RLQ9NZP8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1RLQ9NZP8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RLQ9NZP8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RLQ9NZP8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RLQ9NZP8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1RLQ9NZP8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1RLQ9NZP8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1RLQ9NZP8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C1RLQ9NZP8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1RLQ9NZP8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1RLQ9NZP8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1RLQ9NZP8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1RLQ9NZP8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1RLQ9NZP8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1RLQ9NZP8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1RLQ9NZP8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1RLQ9NZP8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1RLQ9NZP8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1RLQ9NZP8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1RLQ9NZP8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1RLQ9NZP8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1RLQ9NZP8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1RLQ9NZP8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1RLQ9NZP8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1RLQ9NZP8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1RLQ9NZP8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1RLQ9NZP8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1RLQ9NZP8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1RLQ9NZP8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1RLQ9NZP8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1RLQ9NZP8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C1RLQ9NZP8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RLQ9NZP8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RLQ9NZP8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RLQ9NZP8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RLQ9NZP8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1RLQ9NZP8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1RLQ9NZP8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1RLQ9NZP8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1RLQ9NZP8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C1RLQ9NZP8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1RLQ9NZP8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1RLQ9NZP8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1RLQ9NZP8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1RLQ9NZP8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1RLQ9NZP8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1RLQ9NZP8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1RLQ9NZP8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1RLQ9NZP8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1RLQ9NZP8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms