Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKBH4Q9NXW9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALKBH4Q9NXW9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALKBH4Q9NXW9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALKBH4Q9NXW9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALKBH4Q9NXW9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALKBH4Q9NXW9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALKBH4Q9NXW9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALKBH4Q9NXW9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALKBH4Q9NXW9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALKBH4Q9NXW9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ALKBH4Q9NXW9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALKBH4Q9NXW9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALKBH4Q9NXW9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALKBH4Q9NXW9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALKBH4Q9NXW9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALKBH4Q9NXW9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALKBH4Q9NXW9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALKBH4Q9NXW9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALKBH4Q9NXW9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALKBH4Q9NXW9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALKBH4Q9NXW9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ALKBH4Q9NXW9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALKBH4Q9NXW9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALKBH4Q9NXW9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALKBH4Q9NXW9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALKBH4Q9NXW9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALKBH4Q9NXW9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALKBH4Q9NXW9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKBH4Q9NXW9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALKBH4Q9NXW9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALKBH4Q9NXW9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ALKBH4Q9NXW9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ALKBH4Q9NXW9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALKBH4Q9NXW9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ALKBH4Q9NXW9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALKBH4Q9NXW9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALKBH4Q9NXW9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALKBH4Q9NXW9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALKBH4Q9NXW9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALKBH4Q9NXW9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALKBH4Q9NXW9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALKBH4Q9NXW9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKBH4Q9NXW9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKBH4Q9NXW9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKBH4Q9NXW9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKBH4Q9NXW9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKBH4Q9NXW9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKBH4Q9NXW9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALKBH4Q9NXW9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKBH4Q9NXW9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKBH4Q9NXW9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALKBH4Q9NXW9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALKBH4Q9NXW9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALKBH4Q9NXW9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALKBH4Q9NXW9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALKBH4Q9NXW9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALKBH4Q9NXW9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALKBH4Q9NXW9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALKBH4Q9NXW9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALKBH4Q9NXW9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALKBH4Q9NXW9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ALKBH4Q9NXW9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALKBH4Q9NXW9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALKBH4Q9NXW9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALKBH4Q9NXW9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKBH4Q9NXW9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKBH4Q9NXW9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALKBH4Q9NXW9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALKBH4Q9NXW9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALKBH4Q9NXW9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALKBH4Q9NXW9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALKBH4Q9NXW9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALKBH4Q9NXW9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALKBH4Q9NXW9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALKBH4Q9NXW9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALKBH4Q9NXW9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALKBH4Q9NXW9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALKBH4Q9NXW9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALKBH4Q9NXW9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALKBH4Q9NXW9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALKBH4Q9NXW9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALKBH4Q9NXW9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALKBH4Q9NXW9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALKBH4Q9NXW9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALKBH4Q9NXW9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALKBH4Q9NXW9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALKBH4Q9NXW9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALKBH4Q9NXW9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALKBH4Q9NXW9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALKBH4Q9NXW9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALKBH4Q9NXW9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALKBH4Q9NXW9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALKBH4Q9NXW9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALKBH4Q9NXW9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALKBH4Q9NXW9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALKBH4Q9NXW9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALKBH4Q9NXW9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALKBH4Q9NXW9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALKBH4Q9NXW9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms