Protein–RNA interactions for Protein: Q9H790

EXO5, Exonuclease V, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO5Q9H790 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXO5Q9H790 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXO5Q9H790 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXO5Q9H790 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXO5Q9H790 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EXO5Q9H790 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXO5Q9H790 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXO5Q9H790 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXO5Q9H790 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXO5Q9H790 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EXO5Q9H790 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXO5Q9H790 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXO5Q9H790 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXO5Q9H790 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXO5Q9H790 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXO5Q9H790 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXO5Q9H790 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXO5Q9H790 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXO5Q9H790 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXO5Q9H790 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXO5Q9H790 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXO5Q9H790 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXO5Q9H790 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXO5Q9H790 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXO5Q9H790 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXO5Q9H790 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EXO5Q9H790 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXO5Q9H790 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXO5Q9H790 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXO5Q9H790 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXO5Q9H790 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXO5Q9H790 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXO5Q9H790 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXO5Q9H790 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXO5Q9H790 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EXO5Q9H790 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EXO5Q9H790 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXO5Q9H790 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXO5Q9H790 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXO5Q9H790 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
EXO5Q9H790 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXO5Q9H790 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXO5Q9H790 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXO5Q9H790 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXO5Q9H790 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXO5Q9H790 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXO5Q9H790 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXO5Q9H790 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXO5Q9H790 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXO5Q9H790 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXO5Q9H790 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXO5Q9H790 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXO5Q9H790 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXO5Q9H790 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXO5Q9H790 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXO5Q9H790 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXO5Q9H790 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXO5Q9H790 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EXO5Q9H790 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXO5Q9H790 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXO5Q9H790 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXO5Q9H790 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXO5Q9H790 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXO5Q9H790 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXO5Q9H790 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXO5Q9H790 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXO5Q9H790 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EXO5Q9H790 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXO5Q9H790 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXO5Q9H790 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXO5Q9H790 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXO5Q9H790 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXO5Q9H790 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXO5Q9H790 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXO5Q9H790 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXO5Q9H790 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXO5Q9H790 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXO5Q9H790 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXO5Q9H790 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EXO5Q9H790 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXO5Q9H790 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXO5Q9H790 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXO5Q9H790 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXO5Q9H790 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXO5Q9H790 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXO5Q9H790 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXO5Q9H790 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXO5Q9H790 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXO5Q9H790 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXO5Q9H790 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXO5Q9H790 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXO5Q9H790 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXO5Q9H790 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EXO5Q9H790 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXO5Q9H790 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXO5Q9H790 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXO5Q9H790 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXO5Q9H790 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXO5Q9H790 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXO5Q9H790 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.4 ms