Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBA1CQ9BQE3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBA1CQ9BQE3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBA1CQ9BQE3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBA1CQ9BQE3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBA1CQ9BQE3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBA1CQ9BQE3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBA1CQ9BQE3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBA1CQ9BQE3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBA1CQ9BQE3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBA1CQ9BQE3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBA1CQ9BQE3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBA1CQ9BQE3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBA1CQ9BQE3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBA1CQ9BQE3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBA1CQ9BQE3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBA1CQ9BQE3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBA1CQ9BQE3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBA1CQ9BQE3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBA1CQ9BQE3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBA1CQ9BQE3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBA1CQ9BQE3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBA1CQ9BQE3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBA1CQ9BQE3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBA1CQ9BQE3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBA1CQ9BQE3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBA1CQ9BQE3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBA1CQ9BQE3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBA1CQ9BQE3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBA1CQ9BQE3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBA1CQ9BQE3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBA1CQ9BQE3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBA1CQ9BQE3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBA1CQ9BQE3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBA1CQ9BQE3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBA1CQ9BQE3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBA1CQ9BQE3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TUBA1CQ9BQE3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBA1CQ9BQE3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBA1CQ9BQE3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBA1CQ9BQE3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBA1CQ9BQE3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBA1CQ9BQE3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBA1CQ9BQE3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBA1CQ9BQE3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBA1CQ9BQE3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBA1CQ9BQE3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBA1CQ9BQE3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBA1CQ9BQE3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBA1CQ9BQE3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBA1CQ9BQE3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBA1CQ9BQE3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBA1CQ9BQE3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBA1CQ9BQE3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBA1CQ9BQE3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBA1CQ9BQE3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBA1CQ9BQE3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBA1CQ9BQE3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBA1CQ9BQE3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBA1CQ9BQE3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBA1CQ9BQE3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBA1CQ9BQE3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBA1CQ9BQE3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBA1CQ9BQE3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBA1CQ9BQE3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBA1CQ9BQE3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBA1CQ9BQE3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBA1CQ9BQE3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBA1CQ9BQE3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBA1CQ9BQE3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBA1CQ9BQE3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBA1CQ9BQE3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBA1CQ9BQE3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBA1CQ9BQE3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBA1CQ9BQE3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBA1CQ9BQE3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBA1CQ9BQE3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBA1CQ9BQE3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBA1CQ9BQE3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBA1CQ9BQE3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBA1CQ9BQE3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBA1CQ9BQE3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBA1CQ9BQE3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBA1CQ9BQE3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBA1CQ9BQE3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBA1CQ9BQE3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBA1CQ9BQE3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBA1CQ9BQE3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBA1CQ9BQE3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBA1CQ9BQE3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBA1CQ9BQE3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBA1CQ9BQE3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBA1CQ9BQE3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBA1CQ9BQE3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBA1CQ9BQE3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBA1CQ9BQE3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBA1CQ9BQE3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBA1CQ9BQE3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms