Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CCDC7Q96M83 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CCDC7Q96M83 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CCDC7Q96M83 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.06
CCDC7Q96M83 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
CCDC7Q96M83 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CCDC7Q96M83 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CCDC7Q96M83 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CCDC7Q96M83 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CCDC7Q96M83 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CCDC7Q96M83 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CCDC7Q96M83 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CCDC7Q96M83 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CCDC7Q96M83 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CCDC7Q96M83 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CCDC7Q96M83 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CCDC7Q96M83 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CCDC7Q96M83 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CCDC7Q96M83 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CCDC7Q96M83 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CCDC7Q96M83 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
CCDC7Q96M83 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
CCDC7Q96M83 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
CCDC7Q96M83 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CCDC7Q96M83 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CCDC7Q96M83 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CCDC7Q96M83 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CCDC7Q96M83 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CCDC7Q96M83 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CCDC7Q96M83 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC7Q96M83 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC7Q96M83 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC7Q96M83 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
CCDC7Q96M83 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CCDC7Q96M83 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CCDC7Q96M83 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CCDC7Q96M83 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC7Q96M83 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC7Q96M83 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC7Q96M83 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC7Q96M83 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC7Q96M83 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
CCDC7Q96M83 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CCDC7Q96M83 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CCDC7Q96M83 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
CCDC7Q96M83 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CCDC7Q96M83 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CCDC7Q96M83 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CCDC7Q96M83 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
CCDC7Q96M83 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CCDC7Q96M83 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CCDC7Q96M83 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CCDC7Q96M83 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
CCDC7Q96M83 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
CCDC7Q96M83 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CCDC7Q96M83 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC39.63■■■■□ 3.93
CCDC7Q96M83 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
CCDC7Q96M83 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CCDC7Q96M83 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CCDC7Q96M83 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CCDC7Q96M83 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
CCDC7Q96M83 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.92
CCDC7Q96M83 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CCDC7Q96M83 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CCDC7Q96M83 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CCDC7Q96M83 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CCDC7Q96M83 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CCDC7Q96M83 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
CCDC7Q96M83 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CCDC7Q96M83 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CCDC7Q96M83 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CCDC7Q96M83 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CCDC7Q96M83 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CCDC7Q96M83 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CCDC7Q96M83 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CCDC7Q96M83 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CCDC7Q96M83 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CCDC7Q96M83 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CCDC7Q96M83 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CCDC7Q96M83 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CCDC7Q96M83 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.88
CCDC7Q96M83 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC7Q96M83 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CCDC7Q96M83 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CCDC7Q96M83 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CCDC7Q96M83 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CCDC7Q96M83 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC7Q96M83 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CCDC7Q96M83 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CCDC7Q96M83 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CCDC7Q96M83 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CCDC7Q96M83 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CCDC7Q96M83 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CCDC7Q96M83 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CCDC7Q96M83 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CCDC7Q96M83 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CCDC7Q96M83 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CCDC7Q96M83 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC7Q96M83 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC7Q96M83 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms