Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRIMPOLQ96LW4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRIMPOLQ96LW4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRIMPOLQ96LW4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRIMPOLQ96LW4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRIMPOLQ96LW4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRIMPOLQ96LW4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRIMPOLQ96LW4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRIMPOLQ96LW4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRIMPOLQ96LW4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRIMPOLQ96LW4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRIMPOLQ96LW4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRIMPOLQ96LW4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRIMPOLQ96LW4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRIMPOLQ96LW4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRIMPOLQ96LW4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRIMPOLQ96LW4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRIMPOLQ96LW4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRIMPOLQ96LW4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRIMPOLQ96LW4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRIMPOLQ96LW4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRIMPOLQ96LW4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRIMPOLQ96LW4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRIMPOLQ96LW4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRIMPOLQ96LW4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRIMPOLQ96LW4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRIMPOLQ96LW4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRIMPOLQ96LW4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRIMPOLQ96LW4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PRIMPOLQ96LW4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRIMPOLQ96LW4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRIMPOLQ96LW4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRIMPOLQ96LW4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRIMPOLQ96LW4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRIMPOLQ96LW4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRIMPOLQ96LW4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRIMPOLQ96LW4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRIMPOLQ96LW4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRIMPOLQ96LW4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRIMPOLQ96LW4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRIMPOLQ96LW4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRIMPOLQ96LW4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRIMPOLQ96LW4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PRIMPOLQ96LW4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRIMPOLQ96LW4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRIMPOLQ96LW4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRIMPOLQ96LW4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRIMPOLQ96LW4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PRIMPOLQ96LW4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PRIMPOLQ96LW4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRIMPOLQ96LW4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PRIMPOLQ96LW4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PRIMPOLQ96LW4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PRIMPOLQ96LW4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PRIMPOLQ96LW4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRIMPOLQ96LW4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PRIMPOLQ96LW4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRIMPOLQ96LW4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRIMPOLQ96LW4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRIMPOLQ96LW4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRIMPOLQ96LW4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRIMPOLQ96LW4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRIMPOLQ96LW4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRIMPOLQ96LW4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRIMPOLQ96LW4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRIMPOLQ96LW4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRIMPOLQ96LW4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRIMPOLQ96LW4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRIMPOLQ96LW4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
PRIMPOLQ96LW4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PRIMPOLQ96LW4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PRIMPOLQ96LW4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRIMPOLQ96LW4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRIMPOLQ96LW4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PRIMPOLQ96LW4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PRIMPOLQ96LW4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRIMPOLQ96LW4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRIMPOLQ96LW4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRIMPOLQ96LW4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRIMPOLQ96LW4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRIMPOLQ96LW4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRIMPOLQ96LW4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRIMPOLQ96LW4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRIMPOLQ96LW4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRIMPOLQ96LW4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PRIMPOLQ96LW4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRIMPOLQ96LW4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRIMPOLQ96LW4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRIMPOLQ96LW4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRIMPOLQ96LW4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRIMPOLQ96LW4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRIMPOLQ96LW4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRIMPOLQ96LW4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRIMPOLQ96LW4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRIMPOLQ96LW4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PRIMPOLQ96LW4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRIMPOLQ96LW4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRIMPOLQ96LW4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRIMPOLQ96LW4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRIMPOLQ96LW4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms