Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRELD1Q96HD1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRELD1Q96HD1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRELD1Q96HD1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRELD1Q96HD1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRELD1Q96HD1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRELD1Q96HD1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRELD1Q96HD1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CRELD1Q96HD1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRELD1Q96HD1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRELD1Q96HD1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRELD1Q96HD1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRELD1Q96HD1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRELD1Q96HD1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRELD1Q96HD1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRELD1Q96HD1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRELD1Q96HD1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CRELD1Q96HD1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRELD1Q96HD1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CRELD1Q96HD1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CRELD1Q96HD1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRELD1Q96HD1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CRELD1Q96HD1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRELD1Q96HD1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRELD1Q96HD1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRELD1Q96HD1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRELD1Q96HD1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CRELD1Q96HD1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRELD1Q96HD1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRELD1Q96HD1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRELD1Q96HD1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CRELD1Q96HD1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRELD1Q96HD1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRELD1Q96HD1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CRELD1Q96HD1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRELD1Q96HD1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRELD1Q96HD1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRELD1Q96HD1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRELD1Q96HD1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CRELD1Q96HD1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRELD1Q96HD1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRELD1Q96HD1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CRELD1Q96HD1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CRELD1Q96HD1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRELD1Q96HD1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRELD1Q96HD1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRELD1Q96HD1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRELD1Q96HD1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRELD1Q96HD1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRELD1Q96HD1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRELD1Q96HD1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRELD1Q96HD1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRELD1Q96HD1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRELD1Q96HD1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRELD1Q96HD1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRELD1Q96HD1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRELD1Q96HD1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRELD1Q96HD1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRELD1Q96HD1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRELD1Q96HD1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRELD1Q96HD1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRELD1Q96HD1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRELD1Q96HD1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRELD1Q96HD1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRELD1Q96HD1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRELD1Q96HD1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRELD1Q96HD1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRELD1Q96HD1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRELD1Q96HD1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRELD1Q96HD1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRELD1Q96HD1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CRELD1Q96HD1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRELD1Q96HD1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRELD1Q96HD1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRELD1Q96HD1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRELD1Q96HD1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRELD1Q96HD1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRELD1Q96HD1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRELD1Q96HD1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRELD1Q96HD1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRELD1Q96HD1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRELD1Q96HD1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRELD1Q96HD1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRELD1Q96HD1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRELD1Q96HD1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRELD1Q96HD1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRELD1Q96HD1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRELD1Q96HD1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CRELD1Q96HD1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRELD1Q96HD1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRELD1Q96HD1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CRELD1Q96HD1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRELD1Q96HD1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRELD1Q96HD1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRELD1Q96HD1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRELD1Q96HD1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRELD1Q96HD1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRELD1Q96HD1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CRELD1Q96HD1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRELD1Q96HD1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms