Protein–RNA interactions for Protein: Q96HB5

CCDC120, Coiled-coil domain-containing protein 120, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC120Q96HB5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC120Q96HB5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC120Q96HB5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC120Q96HB5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC120Q96HB5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC120Q96HB5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC120Q96HB5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC120Q96HB5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC120Q96HB5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC120Q96HB5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC120Q96HB5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC120Q96HB5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC120Q96HB5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC120Q96HB5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC120Q96HB5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC120Q96HB5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC120Q96HB5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC120Q96HB5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC120Q96HB5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC120Q96HB5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC120Q96HB5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC120Q96HB5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC120Q96HB5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC120Q96HB5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC120Q96HB5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC120Q96HB5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC120Q96HB5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC120Q96HB5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC120Q96HB5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC120Q96HB5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC120Q96HB5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC120Q96HB5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC120Q96HB5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC120Q96HB5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC120Q96HB5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC120Q96HB5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC120Q96HB5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC120Q96HB5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC120Q96HB5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC120Q96HB5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC120Q96HB5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC120Q96HB5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC120Q96HB5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC120Q96HB5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC120Q96HB5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC120Q96HB5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC120Q96HB5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC120Q96HB5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC120Q96HB5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC120Q96HB5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC120Q96HB5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC120Q96HB5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC120Q96HB5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC120Q96HB5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC120Q96HB5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC120Q96HB5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC120Q96HB5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC120Q96HB5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC120Q96HB5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC120Q96HB5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC120Q96HB5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC120Q96HB5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC120Q96HB5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC120Q96HB5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC120Q96HB5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC120Q96HB5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC120Q96HB5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC120Q96HB5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC120Q96HB5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC120Q96HB5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC120Q96HB5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC120Q96HB5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC120Q96HB5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC120Q96HB5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC120Q96HB5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC120Q96HB5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC120Q96HB5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC120Q96HB5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC120Q96HB5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC120Q96HB5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC120Q96HB5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC120Q96HB5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC120Q96HB5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC120Q96HB5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC120Q96HB5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC120Q96HB5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC120Q96HB5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC120Q96HB5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC120Q96HB5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC120Q96HB5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC120Q96HB5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC120Q96HB5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC120Q96HB5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC120Q96HB5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC120Q96HB5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC120Q96HB5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC120Q96HB5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC120Q96HB5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC120Q96HB5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC120Q96HB5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms