Protein–RNA interactions for Protein: Q96A59

MARVELD3, MARVEL domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD3Q96A59 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARVELD3Q96A59 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MARVELD3Q96A59 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARVELD3Q96A59 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARVELD3Q96A59 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARVELD3Q96A59 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARVELD3Q96A59 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MARVELD3Q96A59 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MARVELD3Q96A59 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MARVELD3Q96A59 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MARVELD3Q96A59 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MARVELD3Q96A59 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MARVELD3Q96A59 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MARVELD3Q96A59 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MARVELD3Q96A59 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MARVELD3Q96A59 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MARVELD3Q96A59 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MARVELD3Q96A59 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MARVELD3Q96A59 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MARVELD3Q96A59 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MARVELD3Q96A59 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MARVELD3Q96A59 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MARVELD3Q96A59 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MARVELD3Q96A59 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MARVELD3Q96A59 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARVELD3Q96A59 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MARVELD3Q96A59 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MARVELD3Q96A59 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARVELD3Q96A59 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARVELD3Q96A59 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARVELD3Q96A59 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MARVELD3Q96A59 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MARVELD3Q96A59 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARVELD3Q96A59 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARVELD3Q96A59 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARVELD3Q96A59 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARVELD3Q96A59 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARVELD3Q96A59 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARVELD3Q96A59 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARVELD3Q96A59 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARVELD3Q96A59 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARVELD3Q96A59 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARVELD3Q96A59 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARVELD3Q96A59 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARVELD3Q96A59 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARVELD3Q96A59 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARVELD3Q96A59 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MARVELD3Q96A59 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARVELD3Q96A59 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARVELD3Q96A59 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MARVELD3Q96A59 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MARVELD3Q96A59 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARVELD3Q96A59 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARVELD3Q96A59 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARVELD3Q96A59 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARVELD3Q96A59 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARVELD3Q96A59 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARVELD3Q96A59 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARVELD3Q96A59 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARVELD3Q96A59 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARVELD3Q96A59 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARVELD3Q96A59 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARVELD3Q96A59 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARVELD3Q96A59 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARVELD3Q96A59 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARVELD3Q96A59 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARVELD3Q96A59 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARVELD3Q96A59 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARVELD3Q96A59 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARVELD3Q96A59 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARVELD3Q96A59 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARVELD3Q96A59 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARVELD3Q96A59 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARVELD3Q96A59 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARVELD3Q96A59 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARVELD3Q96A59 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARVELD3Q96A59 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARVELD3Q96A59 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARVELD3Q96A59 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARVELD3Q96A59 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARVELD3Q96A59 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARVELD3Q96A59 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARVELD3Q96A59 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARVELD3Q96A59 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MARVELD3Q96A59 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARVELD3Q96A59 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARVELD3Q96A59 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARVELD3Q96A59 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARVELD3Q96A59 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARVELD3Q96A59 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARVELD3Q96A59 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARVELD3Q96A59 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARVELD3Q96A59 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARVELD3Q96A59 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARVELD3Q96A59 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARVELD3Q96A59 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARVELD3Q96A59 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MARVELD3Q96A59 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARVELD3Q96A59 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARVELD3Q96A59 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms