Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NKX2-3Q8TAU0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NKX2-3Q8TAU0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NKX2-3Q8TAU0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NKX2-3Q8TAU0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NKX2-3Q8TAU0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NKX2-3Q8TAU0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NKX2-3Q8TAU0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NKX2-3Q8TAU0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NKX2-3Q8TAU0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NKX2-3Q8TAU0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NKX2-3Q8TAU0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NKX2-3Q8TAU0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NKX2-3Q8TAU0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NKX2-3Q8TAU0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NKX2-3Q8TAU0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NKX2-3Q8TAU0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NKX2-3Q8TAU0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NKX2-3Q8TAU0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NKX2-3Q8TAU0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NKX2-3Q8TAU0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NKX2-3Q8TAU0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NKX2-3Q8TAU0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NKX2-3Q8TAU0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NKX2-3Q8TAU0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NKX2-3Q8TAU0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NKX2-3Q8TAU0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NKX2-3Q8TAU0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NKX2-3Q8TAU0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
NKX2-3Q8TAU0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NKX2-3Q8TAU0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NKX2-3Q8TAU0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NKX2-3Q8TAU0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NKX2-3Q8TAU0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NKX2-3Q8TAU0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NKX2-3Q8TAU0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NKX2-3Q8TAU0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NKX2-3Q8TAU0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NKX2-3Q8TAU0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NKX2-3Q8TAU0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NKX2-3Q8TAU0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NKX2-3Q8TAU0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NKX2-3Q8TAU0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NKX2-3Q8TAU0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NKX2-3Q8TAU0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
NKX2-3Q8TAU0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NKX2-3Q8TAU0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NKX2-3Q8TAU0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NKX2-3Q8TAU0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NKX2-3Q8TAU0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NKX2-3Q8TAU0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NKX2-3Q8TAU0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NKX2-3Q8TAU0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NKX2-3Q8TAU0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NKX2-3Q8TAU0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NKX2-3Q8TAU0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NKX2-3Q8TAU0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NKX2-3Q8TAU0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NKX2-3Q8TAU0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NKX2-3Q8TAU0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NKX2-3Q8TAU0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NKX2-3Q8TAU0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NKX2-3Q8TAU0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NKX2-3Q8TAU0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NKX2-3Q8TAU0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NKX2-3Q8TAU0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NKX2-3Q8TAU0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NKX2-3Q8TAU0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NKX2-3Q8TAU0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NKX2-3Q8TAU0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NKX2-3Q8TAU0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NKX2-3Q8TAU0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NKX2-3Q8TAU0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
NKX2-3Q8TAU0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NKX2-3Q8TAU0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NKX2-3Q8TAU0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NKX2-3Q8TAU0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NKX2-3Q8TAU0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NKX2-3Q8TAU0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NKX2-3Q8TAU0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NKX2-3Q8TAU0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NKX2-3Q8TAU0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NKX2-3Q8TAU0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NKX2-3Q8TAU0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NKX2-3Q8TAU0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NKX2-3Q8TAU0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NKX2-3Q8TAU0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
NKX2-3Q8TAU0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NKX2-3Q8TAU0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NKX2-3Q8TAU0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NKX2-3Q8TAU0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NKX2-3Q8TAU0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NKX2-3Q8TAU0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NKX2-3Q8TAU0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NKX2-3Q8TAU0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NKX2-3Q8TAU0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NKX2-3Q8TAU0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NKX2-3Q8TAU0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NKX2-3Q8TAU0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NKX2-3Q8TAU0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms