Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7U9

LINC00469, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00469, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00469Q8N7U9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00469Q8N7U9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00469Q8N7U9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00469Q8N7U9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00469Q8N7U9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00469Q8N7U9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00469Q8N7U9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00469Q8N7U9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00469Q8N7U9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00469Q8N7U9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00469Q8N7U9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00469Q8N7U9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00469Q8N7U9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00469Q8N7U9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00469Q8N7U9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00469Q8N7U9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00469Q8N7U9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00469Q8N7U9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00469Q8N7U9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00469Q8N7U9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00469Q8N7U9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00469Q8N7U9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00469Q8N7U9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00469Q8N7U9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00469Q8N7U9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00469Q8N7U9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00469Q8N7U9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00469Q8N7U9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00469Q8N7U9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00469Q8N7U9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00469Q8N7U9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00469Q8N7U9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINC00469Q8N7U9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINC00469Q8N7U9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00469Q8N7U9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00469Q8N7U9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00469Q8N7U9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00469Q8N7U9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00469Q8N7U9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00469Q8N7U9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00469Q8N7U9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00469Q8N7U9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00469Q8N7U9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00469Q8N7U9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00469Q8N7U9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00469Q8N7U9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00469Q8N7U9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00469Q8N7U9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00469Q8N7U9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00469Q8N7U9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00469Q8N7U9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00469Q8N7U9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00469Q8N7U9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00469Q8N7U9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00469Q8N7U9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00469Q8N7U9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00469Q8N7U9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00469Q8N7U9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00469Q8N7U9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00469Q8N7U9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00469Q8N7U9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00469Q8N7U9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00469Q8N7U9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00469Q8N7U9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00469Q8N7U9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00469Q8N7U9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00469Q8N7U9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00469Q8N7U9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00469Q8N7U9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00469Q8N7U9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00469Q8N7U9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00469Q8N7U9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00469Q8N7U9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00469Q8N7U9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00469Q8N7U9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00469Q8N7U9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00469Q8N7U9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00469Q8N7U9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00469Q8N7U9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00469Q8N7U9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00469Q8N7U9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00469Q8N7U9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00469Q8N7U9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00469Q8N7U9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00469Q8N7U9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00469Q8N7U9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00469Q8N7U9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00469Q8N7U9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00469Q8N7U9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00469Q8N7U9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00469Q8N7U9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00469Q8N7U9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00469Q8N7U9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00469Q8N7U9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00469Q8N7U9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00469Q8N7U9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00469Q8N7U9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00469Q8N7U9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00469Q8N7U9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00469Q8N7U9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms