Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL1

NAV2, Neuron navigator 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAV2Q8IVL1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NAV2Q8IVL1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NAV2Q8IVL1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NAV2Q8IVL1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NAV2Q8IVL1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NAV2Q8IVL1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NAV2Q8IVL1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NAV2Q8IVL1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NAV2Q8IVL1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NAV2Q8IVL1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NAV2Q8IVL1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NAV2Q8IVL1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NAV2Q8IVL1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NAV2Q8IVL1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NAV2Q8IVL1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NAV2Q8IVL1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NAV2Q8IVL1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NAV2Q8IVL1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NAV2Q8IVL1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NAV2Q8IVL1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NAV2Q8IVL1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NAV2Q8IVL1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NAV2Q8IVL1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NAV2Q8IVL1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NAV2Q8IVL1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NAV2Q8IVL1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NAV2Q8IVL1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NAV2Q8IVL1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NAV2Q8IVL1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NAV2Q8IVL1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NAV2Q8IVL1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NAV2Q8IVL1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAV2Q8IVL1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAV2Q8IVL1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NAV2Q8IVL1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NAV2Q8IVL1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NAV2Q8IVL1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAV2Q8IVL1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAV2Q8IVL1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NAV2Q8IVL1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAV2Q8IVL1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAV2Q8IVL1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAV2Q8IVL1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAV2Q8IVL1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAV2Q8IVL1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAV2Q8IVL1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NAV2Q8IVL1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NAV2Q8IVL1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NAV2Q8IVL1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAV2Q8IVL1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAV2Q8IVL1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NAV2Q8IVL1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NAV2Q8IVL1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NAV2Q8IVL1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NAV2Q8IVL1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAV2Q8IVL1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NAV2Q8IVL1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NAV2Q8IVL1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NAV2Q8IVL1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NAV2Q8IVL1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NAV2Q8IVL1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAV2Q8IVL1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NAV2Q8IVL1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NAV2Q8IVL1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NAV2Q8IVL1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NAV2Q8IVL1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NAV2Q8IVL1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NAV2Q8IVL1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NAV2Q8IVL1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NAV2Q8IVL1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NAV2Q8IVL1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NAV2Q8IVL1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAV2Q8IVL1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NAV2Q8IVL1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAV2Q8IVL1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAV2Q8IVL1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAV2Q8IVL1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
NAV2Q8IVL1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAV2Q8IVL1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAV2Q8IVL1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAV2Q8IVL1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAV2Q8IVL1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAV2Q8IVL1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NAV2Q8IVL1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAV2Q8IVL1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NAV2Q8IVL1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAV2Q8IVL1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAV2Q8IVL1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAV2Q8IVL1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAV2Q8IVL1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAV2Q8IVL1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAV2Q8IVL1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAV2Q8IVL1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAV2Q8IVL1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAV2Q8IVL1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAV2Q8IVL1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAV2Q8IVL1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NAV2Q8IVL1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NAV2Q8IVL1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NAV2Q8IVL1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.2 ms