Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDZD4Q76G19 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDZD4Q76G19 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDZD4Q76G19 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDZD4Q76G19 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PDZD4Q76G19 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PDZD4Q76G19 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PDZD4Q76G19 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PDZD4Q76G19 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PDZD4Q76G19 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PDZD4Q76G19 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PDZD4Q76G19 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDZD4Q76G19 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDZD4Q76G19 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDZD4Q76G19 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDZD4Q76G19 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDZD4Q76G19 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
PDZD4Q76G19 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDZD4Q76G19 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDZD4Q76G19 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDZD4Q76G19 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDZD4Q76G19 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDZD4Q76G19 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDZD4Q76G19 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDZD4Q76G19 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDZD4Q76G19 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDZD4Q76G19 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDZD4Q76G19 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDZD4Q76G19 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDZD4Q76G19 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDZD4Q76G19 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDZD4Q76G19 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDZD4Q76G19 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDZD4Q76G19 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDZD4Q76G19 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDZD4Q76G19 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDZD4Q76G19 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDZD4Q76G19 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDZD4Q76G19 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDZD4Q76G19 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDZD4Q76G19 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PDZD4Q76G19 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PDZD4Q76G19 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDZD4Q76G19 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDZD4Q76G19 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDZD4Q76G19 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDZD4Q76G19 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDZD4Q76G19 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDZD4Q76G19 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDZD4Q76G19 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDZD4Q76G19 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDZD4Q76G19 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDZD4Q76G19 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDZD4Q76G19 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDZD4Q76G19 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDZD4Q76G19 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDZD4Q76G19 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDZD4Q76G19 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDZD4Q76G19 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDZD4Q76G19 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDZD4Q76G19 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDZD4Q76G19 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PDZD4Q76G19 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDZD4Q76G19 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDZD4Q76G19 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PDZD4Q76G19 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDZD4Q76G19 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDZD4Q76G19 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDZD4Q76G19 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDZD4Q76G19 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PDZD4Q76G19 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PDZD4Q76G19 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDZD4Q76G19 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDZD4Q76G19 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDZD4Q76G19 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDZD4Q76G19 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDZD4Q76G19 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDZD4Q76G19 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDZD4Q76G19 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDZD4Q76G19 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZD4Q76G19 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDZD4Q76G19 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDZD4Q76G19 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDZD4Q76G19 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PDZD4Q76G19 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDZD4Q76G19 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDZD4Q76G19 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDZD4Q76G19 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDZD4Q76G19 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDZD4Q76G19 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDZD4Q76G19 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDZD4Q76G19 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDZD4Q76G19 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDZD4Q76G19 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PDZD4Q76G19 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDZD4Q76G19 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDZD4Q76G19 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDZD4Q76G19 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDZD4Q76G19 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDZD4Q76G19 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms