Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1QL3Q5VWW1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C1QL3Q5VWW1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C1QL3Q5VWW1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
C1QL3Q5VWW1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
C1QL3Q5VWW1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C1QL3Q5VWW1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C1QL3Q5VWW1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1QL3Q5VWW1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
C1QL3Q5VWW1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1QL3Q5VWW1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C1QL3Q5VWW1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C1QL3Q5VWW1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C1QL3Q5VWW1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C1QL3Q5VWW1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C1QL3Q5VWW1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C1QL3Q5VWW1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C1QL3Q5VWW1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C1QL3Q5VWW1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1QL3Q5VWW1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1QL3Q5VWW1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C1QL3Q5VWW1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C1QL3Q5VWW1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
C1QL3Q5VWW1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
C1QL3Q5VWW1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C1QL3Q5VWW1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1QL3Q5VWW1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1QL3Q5VWW1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1QL3Q5VWW1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1QL3Q5VWW1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1QL3Q5VWW1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1QL3Q5VWW1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C1QL3Q5VWW1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C1QL3Q5VWW1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1QL3Q5VWW1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1QL3Q5VWW1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1QL3Q5VWW1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C1QL3Q5VWW1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1QL3Q5VWW1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1QL3Q5VWW1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1QL3Q5VWW1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
C1QL3Q5VWW1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1QL3Q5VWW1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1QL3Q5VWW1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1QL3Q5VWW1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1QL3Q5VWW1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1QL3Q5VWW1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1QL3Q5VWW1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1QL3Q5VWW1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1QL3Q5VWW1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1QL3Q5VWW1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1QL3Q5VWW1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C1QL3Q5VWW1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
C1QL3Q5VWW1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1QL3Q5VWW1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1QL3Q5VWW1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1QL3Q5VWW1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C1QL3Q5VWW1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C1QL3Q5VWW1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
C1QL3Q5VWW1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1QL3Q5VWW1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1QL3Q5VWW1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C1QL3Q5VWW1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1QL3Q5VWW1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C1QL3Q5VWW1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1QL3Q5VWW1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1QL3Q5VWW1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1QL3Q5VWW1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1QL3Q5VWW1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1QL3Q5VWW1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
C1QL3Q5VWW1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1QL3Q5VWW1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1QL3Q5VWW1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1QL3Q5VWW1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1QL3Q5VWW1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1QL3Q5VWW1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
C1QL3Q5VWW1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1QL3Q5VWW1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
C1QL3Q5VWW1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QL3Q5VWW1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QL3Q5VWW1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QL3Q5VWW1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1QL3Q5VWW1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
C1QL3Q5VWW1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1QL3Q5VWW1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
C1QL3Q5VWW1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1QL3Q5VWW1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1QL3Q5VWW1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1QL3Q5VWW1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C1QL3Q5VWW1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C1QL3Q5VWW1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C1QL3Q5VWW1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C1QL3Q5VWW1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1QL3Q5VWW1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1QL3Q5VWW1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1QL3Q5VWW1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1QL3Q5VWW1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1QL3Q5VWW1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1QL3Q5VWW1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1QL3Q5VWW1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms