Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BROXQ5VW32 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BROXQ5VW32 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BROXQ5VW32 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BROXQ5VW32 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BROXQ5VW32 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BROXQ5VW32 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BROXQ5VW32 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BROXQ5VW32 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BROXQ5VW32 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BROXQ5VW32 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
BROXQ5VW32 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BROXQ5VW32 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BROXQ5VW32 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BROXQ5VW32 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BROXQ5VW32 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BROXQ5VW32 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BROXQ5VW32 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BROXQ5VW32 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BROXQ5VW32 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BROXQ5VW32 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BROXQ5VW32 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BROXQ5VW32 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BROXQ5VW32 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BROXQ5VW32 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BROXQ5VW32 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BROXQ5VW32 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BROXQ5VW32 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BROXQ5VW32 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BROXQ5VW32 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BROXQ5VW32 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BROXQ5VW32 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BROXQ5VW32 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BROXQ5VW32 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BROXQ5VW32 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BROXQ5VW32 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BROXQ5VW32 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BROXQ5VW32 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BROXQ5VW32 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BROXQ5VW32 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BROXQ5VW32 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BROXQ5VW32 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BROXQ5VW32 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BROXQ5VW32 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BROXQ5VW32 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BROXQ5VW32 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BROXQ5VW32 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BROXQ5VW32 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BROXQ5VW32 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BROXQ5VW32 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
BROXQ5VW32 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BROXQ5VW32 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BROXQ5VW32 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BROXQ5VW32 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BROXQ5VW32 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BROXQ5VW32 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BROXQ5VW32 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BROXQ5VW32 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BROXQ5VW32 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BROXQ5VW32 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BROXQ5VW32 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BROXQ5VW32 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BROXQ5VW32 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BROXQ5VW32 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BROXQ5VW32 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BROXQ5VW32 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BROXQ5VW32 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BROXQ5VW32 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BROXQ5VW32 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BROXQ5VW32 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BROXQ5VW32 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BROXQ5VW32 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BROXQ5VW32 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BROXQ5VW32 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BROXQ5VW32 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BROXQ5VW32 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BROXQ5VW32 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
BROXQ5VW32 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BROXQ5VW32 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BROXQ5VW32 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BROXQ5VW32 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BROXQ5VW32 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BROXQ5VW32 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BROXQ5VW32 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BROXQ5VW32 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BROXQ5VW32 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BROXQ5VW32 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BROXQ5VW32 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BROXQ5VW32 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BROXQ5VW32 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BROXQ5VW32 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BROXQ5VW32 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BROXQ5VW32 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BROXQ5VW32 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BROXQ5VW32 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BROXQ5VW32 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BROXQ5VW32 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BROXQ5VW32 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BROXQ5VW32 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BROXQ5VW32 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms