Protein–RNA interactions for Protein: Q5JX71

FAM209A, Protein FAM209A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM209AQ5JX71 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM209AQ5JX71 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM209AQ5JX71 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM209AQ5JX71 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM209AQ5JX71 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM209AQ5JX71 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM209AQ5JX71 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM209AQ5JX71 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM209AQ5JX71 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM209AQ5JX71 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM209AQ5JX71 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM209AQ5JX71 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM209AQ5JX71 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM209AQ5JX71 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM209AQ5JX71 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM209AQ5JX71 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM209AQ5JX71 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM209AQ5JX71 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM209AQ5JX71 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM209AQ5JX71 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM209AQ5JX71 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM209AQ5JX71 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM209AQ5JX71 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM209AQ5JX71 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM209AQ5JX71 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM209AQ5JX71 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM209AQ5JX71 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM209AQ5JX71 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM209AQ5JX71 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM209AQ5JX71 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM209AQ5JX71 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM209AQ5JX71 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM209AQ5JX71 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM209AQ5JX71 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM209AQ5JX71 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM209AQ5JX71 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM209AQ5JX71 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM209AQ5JX71 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM209AQ5JX71 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM209AQ5JX71 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM209AQ5JX71 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM209AQ5JX71 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM209AQ5JX71 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM209AQ5JX71 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM209AQ5JX71 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM209AQ5JX71 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM209AQ5JX71 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM209AQ5JX71 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM209AQ5JX71 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM209AQ5JX71 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM209AQ5JX71 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM209AQ5JX71 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM209AQ5JX71 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM209AQ5JX71 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM209AQ5JX71 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM209AQ5JX71 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM209AQ5JX71 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM209AQ5JX71 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM209AQ5JX71 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM209AQ5JX71 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM209AQ5JX71 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM209AQ5JX71 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM209AQ5JX71 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM209AQ5JX71 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM209AQ5JX71 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM209AQ5JX71 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM209AQ5JX71 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM209AQ5JX71 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM209AQ5JX71 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM209AQ5JX71 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM209AQ5JX71 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM209AQ5JX71 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM209AQ5JX71 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM209AQ5JX71 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM209AQ5JX71 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM209AQ5JX71 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM209AQ5JX71 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM209AQ5JX71 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM209AQ5JX71 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM209AQ5JX71 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM209AQ5JX71 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM209AQ5JX71 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM209AQ5JX71 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM209AQ5JX71 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM209AQ5JX71 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM209AQ5JX71 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM209AQ5JX71 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM209AQ5JX71 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM209AQ5JX71 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM209AQ5JX71 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM209AQ5JX71 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM209AQ5JX71 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM209AQ5JX71 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM209AQ5JX71 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM209AQ5JX71 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM209AQ5JX71 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM209AQ5JX71 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM209AQ5JX71 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM209AQ5JX71 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM209AQ5JX71 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms