Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
KIF4BQ2VIQ3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
KIF4BQ2VIQ3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
KIF4BQ2VIQ3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KIF4BQ2VIQ3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
KIF4BQ2VIQ3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
KIF4BQ2VIQ3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
KIF4BQ2VIQ3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
KIF4BQ2VIQ3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KIF4BQ2VIQ3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
KIF4BQ2VIQ3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KIF4BQ2VIQ3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KIF4BQ2VIQ3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KIF4BQ2VIQ3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
KIF4BQ2VIQ3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KIF4BQ2VIQ3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KIF4BQ2VIQ3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KIF4BQ2VIQ3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KIF4BQ2VIQ3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
KIF4BQ2VIQ3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
KIF4BQ2VIQ3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
KIF4BQ2VIQ3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
KIF4BQ2VIQ3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
KIF4BQ2VIQ3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
KIF4BQ2VIQ3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KIF4BQ2VIQ3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KIF4BQ2VIQ3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KIF4BQ2VIQ3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
KIF4BQ2VIQ3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
KIF4BQ2VIQ3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KIF4BQ2VIQ3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KIF4BQ2VIQ3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
KIF4BQ2VIQ3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35■■■■□ 3.19
KIF4BQ2VIQ3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
KIF4BQ2VIQ3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KIF4BQ2VIQ3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
KIF4BQ2VIQ3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
KIF4BQ2VIQ3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KIF4BQ2VIQ3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
KIF4BQ2VIQ3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
KIF4BQ2VIQ3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
KIF4BQ2VIQ3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
KIF4BQ2VIQ3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
KIF4BQ2VIQ3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KIF4BQ2VIQ3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
KIF4BQ2VIQ3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
KIF4BQ2VIQ3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
KIF4BQ2VIQ3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
KIF4BQ2VIQ3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
KIF4BQ2VIQ3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
KIF4BQ2VIQ3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
KIF4BQ2VIQ3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
KIF4BQ2VIQ3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KIF4BQ2VIQ3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KIF4BQ2VIQ3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KIF4BQ2VIQ3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KIF4BQ2VIQ3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KIF4BQ2VIQ3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KIF4BQ2VIQ3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KIF4BQ2VIQ3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
KIF4BQ2VIQ3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KIF4BQ2VIQ3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KIF4BQ2VIQ3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KIF4BQ2VIQ3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KIF4BQ2VIQ3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KIF4BQ2VIQ3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KIF4BQ2VIQ3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
KIF4BQ2VIQ3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
KIF4BQ2VIQ3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KIF4BQ2VIQ3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KIF4BQ2VIQ3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KIF4BQ2VIQ3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KIF4BQ2VIQ3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KIF4BQ2VIQ3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KIF4BQ2VIQ3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
KIF4BQ2VIQ3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KIF4BQ2VIQ3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KIF4BQ2VIQ3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KIF4BQ2VIQ3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KIF4BQ2VIQ3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KIF4BQ2VIQ3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
KIF4BQ2VIQ3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
KIF4BQ2VIQ3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
KIF4BQ2VIQ3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KIF4BQ2VIQ3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KIF4BQ2VIQ3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KIF4BQ2VIQ3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KIF4BQ2VIQ3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KIF4BQ2VIQ3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KIF4BQ2VIQ3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
KIF4BQ2VIQ3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KIF4BQ2VIQ3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KIF4BQ2VIQ3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KIF4BQ2VIQ3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KIF4BQ2VIQ3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KIF4BQ2VIQ3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
KIF4BQ2VIQ3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
KIF4BQ2VIQ3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KIF4BQ2VIQ3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KIF4BQ2VIQ3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms