Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMED1Q13445 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMED1Q13445 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMED1Q13445 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMED1Q13445 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMED1Q13445 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMED1Q13445 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMED1Q13445 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMED1Q13445 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMED1Q13445 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMED1Q13445 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMED1Q13445 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMED1Q13445 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMED1Q13445 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMED1Q13445 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMED1Q13445 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMED1Q13445 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMED1Q13445 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TMED1Q13445 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMED1Q13445 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMED1Q13445 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMED1Q13445 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMED1Q13445 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMED1Q13445 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMED1Q13445 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMED1Q13445 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMED1Q13445 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMED1Q13445 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMED1Q13445 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMED1Q13445 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMED1Q13445 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMED1Q13445 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMED1Q13445 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMED1Q13445 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMED1Q13445 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMED1Q13445 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMED1Q13445 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMED1Q13445 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMED1Q13445 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMED1Q13445 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMED1Q13445 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMED1Q13445 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMED1Q13445 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMED1Q13445 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMED1Q13445 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMED1Q13445 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMED1Q13445 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMED1Q13445 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMED1Q13445 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMED1Q13445 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMED1Q13445 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMED1Q13445 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMED1Q13445 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMED1Q13445 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMED1Q13445 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMED1Q13445 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMED1Q13445 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMED1Q13445 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMED1Q13445 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMED1Q13445 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMED1Q13445 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMED1Q13445 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMED1Q13445 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMED1Q13445 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMED1Q13445 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMED1Q13445 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMED1Q13445 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMED1Q13445 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMED1Q13445 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMED1Q13445 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMED1Q13445 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMED1Q13445 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMED1Q13445 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMED1Q13445 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMED1Q13445 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMED1Q13445 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMED1Q13445 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMED1Q13445 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMED1Q13445 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMED1Q13445 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMED1Q13445 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMED1Q13445 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMED1Q13445 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMED1Q13445 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMED1Q13445 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMED1Q13445 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMED1Q13445 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMED1Q13445 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMED1Q13445 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMED1Q13445 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMED1Q13445 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMED1Q13445 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMED1Q13445 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMED1Q13445 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMED1Q13445 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMED1Q13445 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMED1Q13445 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMED1Q13445 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMED1Q13445 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMED1Q13445 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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