Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA1BQ00975 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA1BQ00975 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNA1BQ00975 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNA1BQ00975 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA1BQ00975 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA1BQ00975 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNA1BQ00975 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CACNA1BQ00975 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNA1BQ00975 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNA1BQ00975 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNA1BQ00975 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNA1BQ00975 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNA1BQ00975 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNA1BQ00975 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNA1BQ00975 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA1BQ00975 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNA1BQ00975 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNA1BQ00975 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CACNA1BQ00975 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNA1BQ00975 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNA1BQ00975 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA1BQ00975 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNA1BQ00975 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNA1BQ00975 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA1BQ00975 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA1BQ00975 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA1BQ00975 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA1BQ00975 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA1BQ00975 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNA1BQ00975 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1BQ00975 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA1BQ00975 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA1BQ00975 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1BQ00975 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1BQ00975 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1BQ00975 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1BQ00975 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1BQ00975 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1BQ00975 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1BQ00975 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1BQ00975 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1BQ00975 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA1BQ00975 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA1BQ00975 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA1BQ00975 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNA1BQ00975 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNA1BQ00975 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNA1BQ00975 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA1BQ00975 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA1BQ00975 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA1BQ00975 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNA1BQ00975 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA1BQ00975 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA1BQ00975 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA1BQ00975 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA1BQ00975 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1BQ00975 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1BQ00975 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1BQ00975 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA1BQ00975 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1BQ00975 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1BQ00975 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA1BQ00975 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA1BQ00975 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA1BQ00975 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA1BQ00975 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA1BQ00975 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA1BQ00975 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1BQ00975 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1BQ00975 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1BQ00975 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA1BQ00975 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA1BQ00975 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA1BQ00975 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA1BQ00975 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CACNA1BQ00975 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA1BQ00975 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA1BQ00975 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA1BQ00975 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA1BQ00975 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNA1BQ00975 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNA1BQ00975 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA1BQ00975 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA1BQ00975 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA1BQ00975 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA1BQ00975 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA1BQ00975 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA1BQ00975 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA1BQ00975 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA1BQ00975 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA1BQ00975 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA1BQ00975 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA1BQ00975 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1BQ00975 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1BQ00975 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1BQ00975 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNA1BQ00975 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1BQ00975 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA1BQ00975 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms