Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB4BP61018 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB4BP61018 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB4BP61018 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB4BP61018 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB4BP61018 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB4BP61018 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB4BP61018 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB4BP61018 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB4BP61018 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB4BP61018 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB4BP61018 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB4BP61018 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB4BP61018 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB4BP61018 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB4BP61018 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB4BP61018 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB4BP61018 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB4BP61018 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB4BP61018 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB4BP61018 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB4BP61018 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB4BP61018 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB4BP61018 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB4BP61018 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB4BP61018 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB4BP61018 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB4BP61018 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB4BP61018 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB4BP61018 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB4BP61018 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB4BP61018 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB4BP61018 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB4BP61018 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB4BP61018 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB4BP61018 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB4BP61018 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB4BP61018 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB4BP61018 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB4BP61018 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB4BP61018 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB4BP61018 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB4BP61018 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB4BP61018 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB4BP61018 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB4BP61018 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB4BP61018 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB4BP61018 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB4BP61018 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB4BP61018 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB4BP61018 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB4BP61018 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB4BP61018 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB4BP61018 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB4BP61018 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB4BP61018 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB4BP61018 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB4BP61018 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB4BP61018 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB4BP61018 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB4BP61018 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB4BP61018 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB4BP61018 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB4BP61018 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB4BP61018 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB4BP61018 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB4BP61018 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB4BP61018 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB4BP61018 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB4BP61018 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB4BP61018 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB4BP61018 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB4BP61018 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB4BP61018 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB4BP61018 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB4BP61018 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB4BP61018 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB4BP61018 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB4BP61018 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB4BP61018 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB4BP61018 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB4BP61018 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB4BP61018 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB4BP61018 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB4BP61018 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB4BP61018 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB4BP61018 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB4BP61018 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB4BP61018 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB4BP61018 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB4BP61018 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB4BP61018 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB4BP61018 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB4BP61018 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB4BP61018 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB4BP61018 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB4BP61018 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB4BP61018 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB4BP61018 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB4BP61018 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms