Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
SOX10P56693 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SOX10P56693 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SOX10P56693 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SOX10P56693 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SOX10P56693 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
SOX10P56693 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SOX10P56693 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SOX10P56693 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SOX10P56693 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SOX10P56693 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SOX10P56693 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SOX10P56693 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SOX10P56693 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SOX10P56693 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SOX10P56693 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SOX10P56693 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SOX10P56693 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SOX10P56693 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
SOX10P56693 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SOX10P56693 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SOX10P56693 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SOX10P56693 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SOX10P56693 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
SOX10P56693 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SOX10P56693 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SOX10P56693 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SOX10P56693 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SOX10P56693 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SOX10P56693 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SOX10P56693 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SOX10P56693 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SOX10P56693 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SOX10P56693 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SOX10P56693 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SOX10P56693 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SOX10P56693 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SOX10P56693 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SOX10P56693 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SOX10P56693 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
SOX10P56693 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SOX10P56693 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SOX10P56693 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SOX10P56693 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SOX10P56693 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SOX10P56693 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SOX10P56693 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SOX10P56693 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SOX10P56693 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SOX10P56693 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SOX10P56693 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SOX10P56693 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SOX10P56693 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SOX10P56693 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SOX10P56693 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SOX10P56693 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SOX10P56693 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SOX10P56693 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SOX10P56693 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SOX10P56693 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SOX10P56693 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SOX10P56693 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SOX10P56693 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SOX10P56693 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SOX10P56693 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SOX10P56693 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SOX10P56693 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SOX10P56693 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SOX10P56693 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SOX10P56693 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SOX10P56693 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SOX10P56693 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SOX10P56693 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SOX10P56693 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SOX10P56693 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SOX10P56693 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SOX10P56693 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SOX10P56693 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
SOX10P56693 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SOX10P56693 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SOX10P56693 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SOX10P56693 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SOX10P56693 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SOX10P56693 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SOX10P56693 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SOX10P56693 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SOX10P56693 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SOX10P56693 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SOX10P56693 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SOX10P56693 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SOX10P56693 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SOX10P56693 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SOX10P56693 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SOX10P56693 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SOX10P56693 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SOX10P56693 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SOX10P56693 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SOX10P56693 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SOX10P56693 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SOX10P56693 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms