Protein–RNA interactions for Protein: P56181

NDUFV3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFV3P56181 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFV3P56181 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFV3P56181 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFV3P56181 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFV3P56181 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFV3P56181 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFV3P56181 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFV3P56181 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFV3P56181 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFV3P56181 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFV3P56181 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDUFV3P56181 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDUFV3P56181 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDUFV3P56181 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFV3P56181 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFV3P56181 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFV3P56181 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFV3P56181 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFV3P56181 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFV3P56181 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFV3P56181 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFV3P56181 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFV3P56181 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFV3P56181 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFV3P56181 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFV3P56181 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFV3P56181 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFV3P56181 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFV3P56181 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFV3P56181 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFV3P56181 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFV3P56181 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFV3P56181 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFV3P56181 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFV3P56181 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFV3P56181 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFV3P56181 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFV3P56181 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFV3P56181 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFV3P56181 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFV3P56181 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFV3P56181 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFV3P56181 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFV3P56181 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFV3P56181 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFV3P56181 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NDUFV3P56181 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NDUFV3P56181 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFV3P56181 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFV3P56181 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFV3P56181 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFV3P56181 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFV3P56181 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFV3P56181 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFV3P56181 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFV3P56181 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFV3P56181 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFV3P56181 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFV3P56181 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFV3P56181 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFV3P56181 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFV3P56181 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFV3P56181 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFV3P56181 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFV3P56181 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFV3P56181 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFV3P56181 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFV3P56181 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFV3P56181 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFV3P56181 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFV3P56181 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFV3P56181 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFV3P56181 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFV3P56181 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFV3P56181 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFV3P56181 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFV3P56181 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFV3P56181 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFV3P56181 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFV3P56181 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFV3P56181 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDUFV3P56181 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDUFV3P56181 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFV3P56181 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFV3P56181 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDUFV3P56181 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDUFV3P56181 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDUFV3P56181 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDUFV3P56181 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDUFV3P56181 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDUFV3P56181 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDUFV3P56181 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDUFV3P56181 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDUFV3P56181 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDUFV3P56181 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFV3P56181 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFV3P56181 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFV3P56181 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFV3P56181 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFV3P56181 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms