Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NRIP1P48552 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NRIP1P48552 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NRIP1P48552 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NRIP1P48552 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NRIP1P48552 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NRIP1P48552 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NRIP1P48552 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NRIP1P48552 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NRIP1P48552 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NRIP1P48552 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NRIP1P48552 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NRIP1P48552 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NRIP1P48552 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NRIP1P48552 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NRIP1P48552 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
NRIP1P48552 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NRIP1P48552 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NRIP1P48552 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NRIP1P48552 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NRIP1P48552 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NRIP1P48552 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NRIP1P48552 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NRIP1P48552 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NRIP1P48552 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NRIP1P48552 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NRIP1P48552 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
NRIP1P48552 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NRIP1P48552 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NRIP1P48552 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRIP1P48552 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NRIP1P48552 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NRIP1P48552 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NRIP1P48552 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NRIP1P48552 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NRIP1P48552 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRIP1P48552 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NRIP1P48552 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NRIP1P48552 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NRIP1P48552 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NRIP1P48552 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NRIP1P48552 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NRIP1P48552 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NRIP1P48552 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
NRIP1P48552 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NRIP1P48552 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NRIP1P48552 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NRIP1P48552 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NRIP1P48552 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NRIP1P48552 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRIP1P48552 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NRIP1P48552 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NRIP1P48552 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NRIP1P48552 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRIP1P48552 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRIP1P48552 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRIP1P48552 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NRIP1P48552 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NRIP1P48552 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NRIP1P48552 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NRIP1P48552 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NRIP1P48552 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NRIP1P48552 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NRIP1P48552 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NRIP1P48552 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NRIP1P48552 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NRIP1P48552 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NRIP1P48552 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NRIP1P48552 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NRIP1P48552 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRIP1P48552 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRIP1P48552 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
NRIP1P48552 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NRIP1P48552 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NRIP1P48552 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NRIP1P48552 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NRIP1P48552 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NRIP1P48552 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
NRIP1P48552 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NRIP1P48552 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NRIP1P48552 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
NRIP1P48552 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NRIP1P48552 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NRIP1P48552 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NRIP1P48552 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NRIP1P48552 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NRIP1P48552 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NRIP1P48552 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NRIP1P48552 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NRIP1P48552 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NRIP1P48552 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NRIP1P48552 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NRIP1P48552 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NRIP1P48552 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NRIP1P48552 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NRIP1P48552 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NRIP1P48552 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NRIP1P48552 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NRIP1P48552 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NRIP1P48552 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms