Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP62P37198 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP62P37198 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP62P37198 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP62P37198 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP62P37198 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP62P37198 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP62P37198 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP62P37198 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP62P37198 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP62P37198 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP62P37198 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP62P37198 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP62P37198 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP62P37198 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP62P37198 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP62P37198 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP62P37198 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP62P37198 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP62P37198 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP62P37198 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP62P37198 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP62P37198 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP62P37198 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP62P37198 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP62P37198 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP62P37198 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP62P37198 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP62P37198 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP62P37198 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP62P37198 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP62P37198 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP62P37198 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP62P37198 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP62P37198 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP62P37198 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP62P37198 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP62P37198 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP62P37198 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP62P37198 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP62P37198 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP62P37198 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP62P37198 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP62P37198 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP62P37198 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP62P37198 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP62P37198 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP62P37198 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP62P37198 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP62P37198 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP62P37198 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP62P37198 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP62P37198 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP62P37198 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP62P37198 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP62P37198 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP62P37198 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP62P37198 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP62P37198 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP62P37198 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP62P37198 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP62P37198 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP62P37198 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP62P37198 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP62P37198 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP62P37198 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP62P37198 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP62P37198 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP62P37198 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP62P37198 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP62P37198 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP62P37198 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62P37198 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62P37198 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP62P37198 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP62P37198 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62P37198 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62P37198 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62P37198 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP62P37198 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP62P37198 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP62P37198 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP62P37198 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP62P37198 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP62P37198 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP62P37198 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP62P37198 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP62P37198 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP62P37198 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP62P37198 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP62P37198 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP62P37198 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP62P37198 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP62P37198 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP62P37198 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP62P37198 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP62P37198 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP62P37198 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP62P37198 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP62P37198 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms