Protein–RNA interactions for Protein: P35354

PTGS2, Prostaglandin G/H synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS2P35354 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTGS2P35354 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTGS2P35354 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTGS2P35354 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTGS2P35354 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTGS2P35354 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTGS2P35354 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTGS2P35354 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTGS2P35354 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTGS2P35354 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTGS2P35354 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTGS2P35354 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTGS2P35354 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTGS2P35354 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTGS2P35354 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTGS2P35354 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTGS2P35354 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTGS2P35354 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTGS2P35354 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTGS2P35354 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGS2P35354 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGS2P35354 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGS2P35354 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTGS2P35354 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTGS2P35354 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTGS2P35354 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTGS2P35354 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTGS2P35354 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGS2P35354 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGS2P35354 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTGS2P35354 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTGS2P35354 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGS2P35354 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGS2P35354 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGS2P35354 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGS2P35354 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGS2P35354 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGS2P35354 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGS2P35354 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGS2P35354 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGS2P35354 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTGS2P35354 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTGS2P35354 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTGS2P35354 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGS2P35354 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGS2P35354 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGS2P35354 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGS2P35354 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTGS2P35354 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGS2P35354 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGS2P35354 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTGS2P35354 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGS2P35354 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGS2P35354 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGS2P35354 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGS2P35354 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGS2P35354 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGS2P35354 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGS2P35354 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGS2P35354 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGS2P35354 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGS2P35354 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGS2P35354 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGS2P35354 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGS2P35354 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGS2P35354 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGS2P35354 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGS2P35354 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGS2P35354 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGS2P35354 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGS2P35354 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGS2P35354 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGS2P35354 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGS2P35354 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGS2P35354 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGS2P35354 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGS2P35354 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGS2P35354 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGS2P35354 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTGS2P35354 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGS2P35354 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGS2P35354 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGS2P35354 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGS2P35354 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGS2P35354 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGS2P35354 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGS2P35354 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGS2P35354 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGS2P35354 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGS2P35354 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTGS2P35354 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTGS2P35354 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGS2P35354 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGS2P35354 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGS2P35354 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGS2P35354 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGS2P35354 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGS2P35354 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGS2P35354 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGS2P35354 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms