Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
GJA4P35212 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GJA4P35212 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GJA4P35212 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GJA4P35212 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GJA4P35212 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GJA4P35212 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GJA4P35212 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GJA4P35212 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GJA4P35212 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GJA4P35212 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GJA4P35212 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJA4P35212 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJA4P35212 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJA4P35212 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GJA4P35212 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJA4P35212 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJA4P35212 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
GJA4P35212 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GJA4P35212 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJA4P35212 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJA4P35212 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJA4P35212 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GJA4P35212 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GJA4P35212 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GJA4P35212 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GJA4P35212 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GJA4P35212 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GJA4P35212 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GJA4P35212 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GJA4P35212 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GJA4P35212 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJA4P35212 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJA4P35212 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJA4P35212 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJA4P35212 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJA4P35212 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJA4P35212 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJA4P35212 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJA4P35212 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GJA4P35212 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GJA4P35212 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GJA4P35212 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJA4P35212 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GJA4P35212 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJA4P35212 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJA4P35212 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJA4P35212 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
GJA4P35212 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJA4P35212 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GJA4P35212 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJA4P35212 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJA4P35212 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GJA4P35212 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJA4P35212 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJA4P35212 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJA4P35212 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJA4P35212 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJA4P35212 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GJA4P35212 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJA4P35212 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJA4P35212 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJA4P35212 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GJA4P35212 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GJA4P35212 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJA4P35212 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJA4P35212 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GJA4P35212 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJA4P35212 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJA4P35212 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJA4P35212 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJA4P35212 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJA4P35212 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJA4P35212 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJA4P35212 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJA4P35212 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJA4P35212 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJA4P35212 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJA4P35212 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJA4P35212 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJA4P35212 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJA4P35212 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJA4P35212 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJA4P35212 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJA4P35212 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GJA4P35212 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GJA4P35212 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GJA4P35212 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJA4P35212 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJA4P35212 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJA4P35212 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GJA4P35212 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJA4P35212 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GJA4P35212 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJA4P35212 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJA4P35212 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJA4P35212 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJA4P35212 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
GJA4P35212 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GJA4P35212 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms