Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBMS1P29558 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBMS1P29558 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBMS1P29558 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RBMS1P29558 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RBMS1P29558 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RBMS1P29558 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RBMS1P29558 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBMS1P29558 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBMS1P29558 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBMS1P29558 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBMS1P29558 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBMS1P29558 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBMS1P29558 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBMS1P29558 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBMS1P29558 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBMS1P29558 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBMS1P29558 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBMS1P29558 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RBMS1P29558 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBMS1P29558 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBMS1P29558 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBMS1P29558 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBMS1P29558 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBMS1P29558 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBMS1P29558 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBMS1P29558 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBMS1P29558 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBMS1P29558 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBMS1P29558 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBMS1P29558 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBMS1P29558 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBMS1P29558 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBMS1P29558 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBMS1P29558 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBMS1P29558 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RBMS1P29558 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBMS1P29558 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBMS1P29558 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBMS1P29558 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBMS1P29558 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RBMS1P29558 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RBMS1P29558 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RBMS1P29558 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBMS1P29558 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBMS1P29558 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBMS1P29558 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBMS1P29558 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBMS1P29558 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBMS1P29558 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBMS1P29558 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RBMS1P29558 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBMS1P29558 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBMS1P29558 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBMS1P29558 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBMS1P29558 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBMS1P29558 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBMS1P29558 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RBMS1P29558 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RBMS1P29558 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBMS1P29558 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBMS1P29558 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBMS1P29558 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBMS1P29558 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBMS1P29558 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBMS1P29558 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBMS1P29558 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBMS1P29558 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBMS1P29558 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBMS1P29558 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBMS1P29558 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBMS1P29558 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RBMS1P29558 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RBMS1P29558 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBMS1P29558 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBMS1P29558 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBMS1P29558 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBMS1P29558 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBMS1P29558 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBMS1P29558 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBMS1P29558 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBMS1P29558 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBMS1P29558 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBMS1P29558 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBMS1P29558 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBMS1P29558 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBMS1P29558 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBMS1P29558 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RBMS1P29558 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBMS1P29558 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RBMS1P29558 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RBMS1P29558 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBMS1P29558 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBMS1P29558 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBMS1P29558 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RBMS1P29558 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBMS1P29558 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBMS1P29558 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBMS1P29558 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBMS1P29558 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms