Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA3P26006 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA3P26006 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA3P26006 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGA3P26006 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA3P26006 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA3P26006 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA3P26006 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA3P26006 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA3P26006 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGA3P26006 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA3P26006 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA3P26006 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA3P26006 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA3P26006 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA3P26006 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGA3P26006 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA3P26006 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGA3P26006 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA3P26006 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGA3P26006 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA3P26006 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA3P26006 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA3P26006 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA3P26006 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA3P26006 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA3P26006 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA3P26006 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGA3P26006 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA3P26006 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA3P26006 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA3P26006 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA3P26006 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA3P26006 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA3P26006 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA3P26006 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA3P26006 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA3P26006 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA3P26006 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA3P26006 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA3P26006 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA3P26006 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA3P26006 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA3P26006 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA3P26006 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA3P26006 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA3P26006 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA3P26006 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA3P26006 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA3P26006 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA3P26006 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA3P26006 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA3P26006 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA3P26006 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA3P26006 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA3P26006 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA3P26006 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA3P26006 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA3P26006 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA3P26006 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA3P26006 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA3P26006 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA3P26006 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA3P26006 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA3P26006 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA3P26006 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA3P26006 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA3P26006 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA3P26006 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA3P26006 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA3P26006 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITGA3P26006 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA3P26006 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA3P26006 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGA3P26006 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA3P26006 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA3P26006 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA3P26006 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA3P26006 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA3P26006 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA3P26006 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA3P26006 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA3P26006 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA3P26006 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA3P26006 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA3P26006 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA3P26006 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA3P26006 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA3P26006 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA3P26006 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA3P26006 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA3P26006 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA3P26006 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA3P26006 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA3P26006 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA3P26006 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA3P26006 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA3P26006 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA3P26006 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA3P26006 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms