Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RARGP13631 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RARGP13631 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RARGP13631 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RARGP13631 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RARGP13631 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RARGP13631 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RARGP13631 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RARGP13631 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RARGP13631 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RARGP13631 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RARGP13631 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RARGP13631 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RARGP13631 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RARGP13631 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RARGP13631 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RARGP13631 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
RARGP13631 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RARGP13631 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RARGP13631 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RARGP13631 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RARGP13631 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RARGP13631 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RARGP13631 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RARGP13631 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RARGP13631 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RARGP13631 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RARGP13631 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RARGP13631 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RARGP13631 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RARGP13631 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RARGP13631 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RARGP13631 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RARGP13631 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RARGP13631 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RARGP13631 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RARGP13631 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RARGP13631 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RARGP13631 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RARGP13631 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RARGP13631 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RARGP13631 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RARGP13631 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RARGP13631 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RARGP13631 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RARGP13631 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RARGP13631 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RARGP13631 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RARGP13631 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RARGP13631 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RARGP13631 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RARGP13631 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RARGP13631 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RARGP13631 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RARGP13631 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RARGP13631 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RARGP13631 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RARGP13631 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RARGP13631 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RARGP13631 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RARGP13631 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RARGP13631 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RARGP13631 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RARGP13631 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RARGP13631 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RARGP13631 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RARGP13631 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RARGP13631 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RARGP13631 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RARGP13631 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RARGP13631 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RARGP13631 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RARGP13631 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RARGP13631 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RARGP13631 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RARGP13631 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RARGP13631 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RARGP13631 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RARGP13631 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RARGP13631 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RARGP13631 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RARGP13631 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RARGP13631 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RARGP13631 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RARGP13631 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RARGP13631 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RARGP13631 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RARGP13631 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RARGP13631 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RARGP13631 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RARGP13631 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RARGP13631 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RARGP13631 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RARGP13631 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RARGP13631 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RARGP13631 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RARGP13631 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RARGP13631 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RARGP13631 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RARGP13631 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms