Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CAPNS1P04632 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1P04632 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1P04632 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1P04632 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1P04632 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1P04632 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CAPNS1P04632 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1P04632 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1P04632 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1P04632 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1P04632 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1P04632 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1P04632 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1P04632 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1P04632 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1P04632 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1P04632 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1P04632 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1P04632 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CAPNS1P04632 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1P04632 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1P04632 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1P04632 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1P04632 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1P04632 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1P04632 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1P04632 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1P04632 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1P04632 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1P04632 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1P04632 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1P04632 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1P04632 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1P04632 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1P04632 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1P04632 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1P04632 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1P04632 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1P04632 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1P04632 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1P04632 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1P04632 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1P04632 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1P04632 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1P04632 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1P04632 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1P04632 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1P04632 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1P04632 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1P04632 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1P04632 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1P04632 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1P04632 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1P04632 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1P04632 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1P04632 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPNS1P04632 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1P04632 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1P04632 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1P04632 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1P04632 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1P04632 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1P04632 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1P04632 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1P04632 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1P04632 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1P04632 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1P04632 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1P04632 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1P04632 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPNS1P04632 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAPNS1P04632 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1P04632 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1P04632 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1P04632 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1P04632 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1P04632 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1P04632 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1P04632 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1P04632 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1P04632 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1P04632 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1P04632 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1P04632 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPNS1P04632 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPNS1P04632 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPNS1P04632 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1P04632 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1P04632 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1P04632 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1P04632 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAPNS1P04632 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1P04632 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1P04632 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1P04632 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1P04632 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1P04632 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1P04632 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1P04632 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms