Protein–RNA interactions for Protein: O96015

DNAL4, Dynein light chain 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL4O96015 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAL4O96015 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAL4O96015 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAL4O96015 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAL4O96015 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAL4O96015 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAL4O96015 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAL4O96015 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAL4O96015 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAL4O96015 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAL4O96015 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAL4O96015 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAL4O96015 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DNAL4O96015 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAL4O96015 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAL4O96015 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAL4O96015 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAL4O96015 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAL4O96015 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAL4O96015 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAL4O96015 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAL4O96015 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAL4O96015 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAL4O96015 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAL4O96015 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAL4O96015 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAL4O96015 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAL4O96015 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAL4O96015 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAL4O96015 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAL4O96015 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAL4O96015 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAL4O96015 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAL4O96015 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAL4O96015 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAL4O96015 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAL4O96015 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAL4O96015 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DNAL4O96015 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DNAL4O96015 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DNAL4O96015 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DNAL4O96015 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DNAL4O96015 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DNAL4O96015 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DNAL4O96015 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DNAL4O96015 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DNAL4O96015 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNAL4O96015 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNAL4O96015 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DNAL4O96015 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DNAL4O96015 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DNAL4O96015 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNAL4O96015 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNAL4O96015 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNAL4O96015 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAL4O96015 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAL4O96015 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAL4O96015 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAL4O96015 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAL4O96015 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAL4O96015 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAL4O96015 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAL4O96015 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAL4O96015 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAL4O96015 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAL4O96015 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAL4O96015 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAL4O96015 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DNAL4O96015 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DNAL4O96015 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DNAL4O96015 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DNAL4O96015 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAL4O96015 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAL4O96015 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAL4O96015 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAL4O96015 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAL4O96015 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAL4O96015 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAL4O96015 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAL4O96015 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAL4O96015 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAL4O96015 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAL4O96015 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAL4O96015 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAL4O96015 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAL4O96015 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAL4O96015 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAL4O96015 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAL4O96015 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAL4O96015 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAL4O96015 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAL4O96015 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAL4O96015 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAL4O96015 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAL4O96015 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAL4O96015 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAL4O96015 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAL4O96015 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAL4O96015 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAL4O96015 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms