Protein–RNA interactions for Protein: O75631

UPK3A, Uroplakin-3a, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3AO75631 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPK3AO75631 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPK3AO75631 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UPK3AO75631 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPK3AO75631 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPK3AO75631 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPK3AO75631 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPK3AO75631 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UPK3AO75631 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPK3AO75631 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPK3AO75631 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPK3AO75631 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPK3AO75631 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPK3AO75631 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPK3AO75631 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPK3AO75631 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPK3AO75631 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPK3AO75631 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPK3AO75631 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPK3AO75631 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPK3AO75631 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPK3AO75631 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPK3AO75631 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPK3AO75631 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPK3AO75631 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPK3AO75631 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPK3AO75631 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPK3AO75631 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPK3AO75631 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPK3AO75631 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPK3AO75631 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPK3AO75631 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPK3AO75631 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPK3AO75631 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UPK3AO75631 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UPK3AO75631 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPK3AO75631 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPK3AO75631 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPK3AO75631 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPK3AO75631 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UPK3AO75631 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UPK3AO75631 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UPK3AO75631 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UPK3AO75631 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPK3AO75631 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPK3AO75631 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPK3AO75631 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPK3AO75631 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPK3AO75631 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPK3AO75631 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPK3AO75631 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPK3AO75631 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPK3AO75631 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPK3AO75631 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPK3AO75631 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPK3AO75631 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UPK3AO75631 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPK3AO75631 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPK3AO75631 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPK3AO75631 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPK3AO75631 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPK3AO75631 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPK3AO75631 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPK3AO75631 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPK3AO75631 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPK3AO75631 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPK3AO75631 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPK3AO75631 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPK3AO75631 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPK3AO75631 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPK3AO75631 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPK3AO75631 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UPK3AO75631 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPK3AO75631 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPK3AO75631 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPK3AO75631 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPK3AO75631 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPK3AO75631 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPK3AO75631 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPK3AO75631 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPK3AO75631 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UPK3AO75631 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPK3AO75631 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPK3AO75631 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPK3AO75631 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPK3AO75631 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPK3AO75631 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPK3AO75631 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPK3AO75631 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPK3AO75631 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPK3AO75631 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPK3AO75631 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPK3AO75631 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPK3AO75631 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UPK3AO75631 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPK3AO75631 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPK3AO75631 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPK3AO75631 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPK3AO75631 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPK3AO75631 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms