Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ATG13O75143 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATG13O75143 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATG13O75143 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATG13O75143 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATG13O75143 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATG13O75143 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATG13O75143 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG13O75143 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG13O75143 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG13O75143 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG13O75143 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATG13O75143 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATG13O75143 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATG13O75143 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATG13O75143 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATG13O75143 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATG13O75143 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATG13O75143 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ATG13O75143 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATG13O75143 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATG13O75143 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATG13O75143 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATG13O75143 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATG13O75143 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATG13O75143 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATG13O75143 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATG13O75143 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATG13O75143 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATG13O75143 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATG13O75143 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATG13O75143 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATG13O75143 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATG13O75143 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATG13O75143 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATG13O75143 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATG13O75143 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATG13O75143 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATG13O75143 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATG13O75143 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATG13O75143 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATG13O75143 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ATG13O75143 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG13O75143 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ATG13O75143 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ATG13O75143 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATG13O75143 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG13O75143 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG13O75143 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATG13O75143 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATG13O75143 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ATG13O75143 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATG13O75143 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATG13O75143 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATG13O75143 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG13O75143 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG13O75143 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATG13O75143 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATG13O75143 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG13O75143 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG13O75143 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATG13O75143 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATG13O75143 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ATG13O75143 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATG13O75143 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATG13O75143 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATG13O75143 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATG13O75143 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATG13O75143 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATG13O75143 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG13O75143 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATG13O75143 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATG13O75143 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATG13O75143 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG13O75143 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG13O75143 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATG13O75143 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ATG13O75143 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG13O75143 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG13O75143 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG13O75143 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATG13O75143 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG13O75143 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG13O75143 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG13O75143 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATG13O75143 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATG13O75143 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATG13O75143 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATG13O75143 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG13O75143 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATG13O75143 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATG13O75143 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATG13O75143 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATG13O75143 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ATG13O75143 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG13O75143 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATG13O75143 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ATG13O75143 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG13O75143 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG13O75143 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms